More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0505 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0505  inner-membrane translocator  100 
 
 
293 aa  565  1e-160  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0978839  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  45.39 
 
 
292 aa  259  3e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  33.57 
 
 
290 aa  169  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4711  inner-membrane translocator  33.45 
 
 
292 aa  168  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  32.99 
 
 
290 aa  158  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  32.53 
 
 
290 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  34.34 
 
 
291 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4940  inner-membrane translocator  32.78 
 
 
291 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  35.14 
 
 
294 aa  145  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.45 
 
 
290 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  32.26 
 
 
319 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  33.56 
 
 
287 aa  142  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  35.59 
 
 
293 aa  142  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  32.88 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4820  inner-membrane translocator  29.21 
 
 
290 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0225289  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  34.58 
 
 
294 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.19 
 
 
293 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0998  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.06 
 
 
289 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301783  normal  0.758902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7078  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  30.07 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  32.42 
 
 
292 aa  136  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3583  inner-membrane translocator  31.82 
 
 
289 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.967515  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1781  ABC transporter permease  30.77 
 
 
287 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0603975  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4242  inner-membrane translocator  31.33 
 
 
292 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  30.66 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  29.35 
 
 
302 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  30.87 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23000  branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  31.82 
 
 
292 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.135077  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  32.09 
 
 
292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1003  inner-membrane translocator  27.3 
 
 
290 aa  132  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  29.01 
 
 
302 aa  132  9e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  30.21 
 
 
290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  32.88 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1838  inner-membrane translocator  32.88 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  31.88 
 
 
300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0350  inner-membrane translocator  29.11 
 
 
292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.018915  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  31.89 
 
 
298 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  32.2 
 
 
294 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  29.55 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  30.95 
 
 
294 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  29.27 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  29.35 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1742  inner-membrane translocator  30.56 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0350501  normal  0.0888724 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.48 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.67 
 
 
299 aa  127  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  29.59 
 
 
290 aa  126  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  31.82 
 
 
287 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4095  inner-membrane translocator  32.77 
 
 
294 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  30.28 
 
 
290 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3010  inner-membrane translocator  29.15 
 
 
291 aa  126  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000508141  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  31.46 
 
 
301 aa  125  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3363  inner-membrane translocator  31.82 
 
 
309 aa  125  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  33.45 
 
 
299 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.94 
 
 
316 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  30.54 
 
 
308 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  30.54 
 
 
308 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2444  inner-membrane translocator  32.33 
 
 
304 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3609  inner-membrane translocator  31.07 
 
 
309 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.566086 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  30.48 
 
 
290 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2082  inner-membrane translocator  31.71 
 
 
289 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1163  inner-membrane translocator  34.95 
 
 
290 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1829  inner-membrane translocator  32.99 
 
 
289 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000486818  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  30.85 
 
 
290 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  28.14 
 
 
294 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  28.94 
 
 
316 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3765  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  29.93 
 
 
308 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  28.62 
 
 
316 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.23 
 
 
288 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.62 
 
 
316 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  29.8 
 
 
307 aa  123  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.3 
 
 
316 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.62 
 
 
316 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.9 
 
 
308 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  29.9 
 
 
308 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  30 
 
 
308 aa  122  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.9 
 
 
308 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3934  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  29.93 
 
 
308 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3832  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  29.93 
 
 
308 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377986  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3875  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  29.93 
 
 
308 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3754  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  29.93 
 
 
308 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  30.88 
 
 
287 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  30.17 
 
 
308 aa  122  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4054  inner-membrane translocator  34.34 
 
 
299 aa  122  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1707  inner-membrane translocator  30.8 
 
 
294 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  0.0117709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4297  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.83 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315349  decreased coverage  0.00178163 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3557  inner-membrane translocator  30.23 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258255  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  28.85 
 
 
316 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  29.19 
 
 
308 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  29.08 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3739  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  29.39 
 
 
308 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  29.49 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0258  inner-membrane translocator  29.05 
 
 
308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  31.72 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  28.85 
 
 
316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1182  branched-chain amino acid ABC-type transport system permease components  27.62 
 
 
481 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.729657  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0298  inner-membrane translocator  34.27 
 
 
290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.474045  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1837  inner-membrane translocator  35.05 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000968352  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  29.55 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3936  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  29.05 
 
 
308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03259  hypothetical protein  29.05 
 
 
308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  28.85 
 
 
316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>