More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1160 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1160  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 350 aa  682    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.625358  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0772  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  97.71 
 
 		 350 aa  639    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.136837  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1035  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  98 
 
 		 350 aa  670    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.977456  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1113  branched-chain amino-acid ABC transporter, permease protein  74.5 
 
 		 343 aa  497  1e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0477  inner-membrane translocator  66.16 
 
 		 345 aa  424  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000104814  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0612  inner-membrane translocator  65.41 
 
 		 347 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0401  ABC transport system permease protein  62.99 
 
 		 351 aa  393  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0858  inner-membrane translocator  49.25 
 
 		 345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0267  inner-membrane translocator  47.56 
 
 		 357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000311573  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0637  inner-membrane translocator  42.41 
 
 		 347 aa  247  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000477005  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0613  inner-membrane translocator  44.24 
 
 		 345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1471  inner-membrane translocator  41.79 
 
 		 353 aa  243  3e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0927911  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1608  inner-membrane translocator  42.32 
 
 		 356 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0142848  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1674  inner-membrane translocator  42.03 
 
 		 358 aa  238  8e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1067  inner-membrane translocator  41.8 
 
 		 346 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0499919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2933  inner-membrane translocator  44.58 
 
 		 356 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0934  inner-membrane translocator  39.34 
 
 		 327 aa  189  5.999999999999999e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000511533  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 401 aa  183  3e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 326 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1580  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.93 
 
 		 317 aa  177  3e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.571371  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 297 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2016  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2500  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.78 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1386  inner-membrane translocator  43.05 
 
 		 312 aa  167  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  34.16 
 
 		 300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2554  inner-membrane translocator  39.14 
 
 		 322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2308  inner-membrane translocator  34.99 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1893  branched-chain amino acid ABC transporter permease  34.38 
 
 		 362 aa  162  8.000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00991478  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3293  hypothetical protein  34.5 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2271  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.900398 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2430  inner-membrane translocator  35.08 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.106551  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0462  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 331 aa  152  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3327  inner-membrane translocator  35.01 
 
 		 463 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.630335 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3071  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 463 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4259  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  35.76 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0400  ABC transporter permease  33.33 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3103  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0482  ABC transporter permease  36.25 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3727  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0972645  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4414  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 352 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 337 aa  142  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.51 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3514  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  32.44 
 
 		 463 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4414  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 359 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.743887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4393  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 352 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  30.96 
 
 		 389 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0260  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.62 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2111  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.03 
 
 		 298 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3534  inner-membrane translocator  35.39 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  31 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2396  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 461 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00825655 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  33.72 
 
 		 357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1390  inner-membrane translocator  33.86 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  30.79 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.7 
 
 		 339 aa  137  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 389 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 389 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 389 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.92 
 
 		 389 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  30.08 
 
 		 389 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  30.82 
 
 		 830 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  30.99 
 
 		 389 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1113  inner-membrane translocator  33.04 
 
 		 460 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2707  inner-membrane translocator  33.15 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2317  inner-membrane translocator  33.15 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156371  hitchhiker  0.00287138 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1724  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.53 
 
 		 459 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  30.26 
 
 		 389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1084  inner-membrane translocator  31.98 
 
 		 435 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0450701  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3206  inner-membrane translocator  31.86 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  32.03 
 
 		 358 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  30.68 
 
 		 415 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5395  inner-membrane translocator  29.62 
 
 		 463 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3058  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 408 aa  133  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12681  hitchhiker  0.000339523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2958  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  31.66 
 
 		 389 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1732  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.97 
 
 		 326 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1790  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.92 
 
 		 459 aa  132  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 398 aa  132  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2500  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 407 aa  132  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.62609  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 318 aa  132  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  32.09 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2727  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  29.86 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2439  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  32.16 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0685  inner-membrane translocator  32.35 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00962366  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2082  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1728  inner-membrane translocator  31.74 
 
 		 363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  31.48 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2843  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3018  inner-membrane translocator  31.34 
 
 		 390 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199444  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3033  inner-membrane translocator  31.34 
 
 		 390 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235152  normal  0.243359 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3064  inner-membrane translocator  31.34 
 
 		 426 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.32 
 
 		 389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.32 
 
 		 389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>