More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1608 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1674  inner-membrane translocator  98.03 
 
 		 358 aa  694    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1608  inner-membrane translocator  100 
 
 		 356 aa  704    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0142848  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1471  inner-membrane translocator  67.33 
 
 		 353 aa  483  1e-135  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0927911  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0267  inner-membrane translocator  55.84 
 
 		 357 aa  378  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000311573  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0637  inner-membrane translocator  49.14 
 
 		 347 aa  342  8e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000477005  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0613  inner-membrane translocator  49.12 
 
 		 345 aa  333  3e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1067  inner-membrane translocator  48.81 
 
 		 346 aa  323  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0499919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2933  inner-membrane translocator  47.28 
 
 		 356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0858  inner-membrane translocator  49.54 
 
 		 345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0477  inner-membrane translocator  42.09 
 
 		 345 aa  280  2e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000104814  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1113  branched-chain amino-acid ABC transporter, permease protein  40.57 
 
 		 343 aa  251  2e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1035  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.61 
 
 		 350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.977456  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0772  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.17 
 
 		 350 aa  242  7e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.136837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0612  inner-membrane translocator  41.67 
 
 		 347 aa  239  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1160  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.87 
 
 		 350 aa  239  5.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.625358  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0401  ABC transport system permease protein  43.41 
 
 		 351 aa  228  8e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3293  hypothetical protein  40.17 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0934  inner-membrane translocator  40.81 
 
 		 327 aa  222  9e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000511533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  41.88 
 
 		 326 aa  205  8e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2500  inner-membrane translocator  38.15 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2308  inner-membrane translocator  40.54 
 
 		 372 aa  199  5e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  38.04 
 
 		 324 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.09 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  39.6 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3727  inner-membrane translocator  37.99 
 
 		 334 aa  192  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0972645  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2554  inner-membrane translocator  38.79 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2016  inner-membrane translocator  41.42 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 297 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1580  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.38 
 
 		 317 aa  186  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.571371  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1386  inner-membrane translocator  41.05 
 
 		 312 aa  186  8e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2430  inner-membrane translocator  35.01 
 
 		 340 aa  185  8e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.106551  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  36.92 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0462  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2271  inner-membrane translocator  37 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.900398 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4414  inner-membrane translocator  42.09 
 
 		 359 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.743887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  34.66 
 
 		 401 aa  173  3.9999999999999995e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2111  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.08 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0482  ABC transporter permease  37.91 
 
 		 324 aa  172  6.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1893  branched-chain amino acid ABC transporter permease  38.64 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00991478  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0400  ABC transporter permease  34.98 
 
 		 316 aa  167  4e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.59 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3534  inner-membrane translocator  38.61 
 
 		 333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  34.36 
 
 		 389 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1728  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4259  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  38.69 
 
 		 352 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.44 
 
 		 389 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4414  inner-membrane translocator  38.39 
 
 		 352 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.44 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  33.72 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.17 
 
 		 389 aa  160  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 389 aa  159  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 389 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 389 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 389 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1390  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 334 aa  159  9e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.61 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  34.42 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.61 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 389 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.61 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.61 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.61 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.61 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.61 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1821  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4393  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 352 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  35.58 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0260  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 		 322 aa  157  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  33.91 
 
 		 389 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1732  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.39 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2473  inner-membrane translocator  33.95 
 
 		 373 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3206  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6113  inner-membrane translocator  36.02 
 
 		 389 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 318 aa  149  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  32.35 
 
 		 357 aa  149  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 358 aa  149  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_003296  RS01987  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  34.76 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0685  inner-membrane translocator  31.38 
 
 		 290 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00962366  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4924  inner-membrane translocator  38.93 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0564  inner-membrane translocator  33.61 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00158487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  36.5 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2711  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 415 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4488  ABC transporter related  31.42 
 
 		 624 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 407 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 372 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 321 aa  146  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 407 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2707  inner-membrane translocator  35.38 
 
 		 375 aa  145  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2317  inner-membrane translocator  35.38 
 
 		 375 aa  145  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156371  hitchhiker  0.00287138 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1164  inner-membrane translocator  35.04 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1427  inner-membrane translocator  32.72 
 
 		 286 aa  144  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.732914  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2439  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  35.08 
 
 		 378 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4377  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 355 aa  143  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.684501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  33.05 
 
 		 454 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  36.03 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>