More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1893 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1893  branched-chain amino acid ABC transporter permease  100 
 
 
362 aa  717    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00991478  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  48.09 
 
 
401 aa  263  3e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  43.53 
 
 
326 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0462  inner-membrane translocator  40.06 
 
 
331 aa  222  9e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2500  inner-membrane translocator  43.12 
 
 
317 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0934  inner-membrane translocator  42.86 
 
 
327 aa  220  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000511533  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1386  inner-membrane translocator  44.86 
 
 
312 aa  212  9e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2430  inner-membrane translocator  39.71 
 
 
340 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.106551  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  39.62 
 
 
324 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2308  inner-membrane translocator  36.77 
 
 
372 aa  207  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2016  inner-membrane translocator  40.6 
 
 
318 aa  203  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  42.41 
 
 
407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2554  inner-membrane translocator  40.89 
 
 
322 aa  197  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2111  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.2 
 
 
298 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0482  ABC transporter permease  41.64 
 
 
324 aa  194  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0400  ABC transporter permease  40.3 
 
 
316 aa  194  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  37.8 
 
 
297 aa  193  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  43.15 
 
 
300 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  37.85 
 
 
415 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  37.46 
 
 
407 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  42.22 
 
 
299 aa  189  8e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.45 
 
 
307 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1580  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40 
 
 
317 aa  188  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.571371  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3534  inner-membrane translocator  38.85 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3103  inner-membrane translocator  37.91 
 
 
340 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3337  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.66 
 
 
423 aa  182  9.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  38.7 
 
 
423 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2271  inner-membrane translocator  38.11 
 
 
297 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.900398 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0637  inner-membrane translocator  35.47 
 
 
347 aa  179  8e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000477005  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.54 
 
 
339 aa  178  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4924  inner-membrane translocator  37.46 
 
 
358 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4414  inner-membrane translocator  40.25 
 
 
359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.743887  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.16 
 
 
418 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4110  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.61 
 
 
421 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.015431  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4743  inner-membrane translocator  37.66 
 
 
433 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127702  hitchhiker  0.000000177935 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1471  inner-membrane translocator  35.36 
 
 
353 aa  170  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0927911  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  38.7 
 
 
327 aa  170  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0554  inner-membrane translocator  37.03 
 
 
433 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0237898  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1674  inner-membrane translocator  37.58 
 
 
358 aa  169  6e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4865  inner-membrane translocator  37.66 
 
 
435 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307682  hitchhiker  0.00000605126 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3847  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.93 
 
 
421 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0194014  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0613  inner-membrane translocator  35.49 
 
 
345 aa  169  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1608  inner-membrane translocator  36.14 
 
 
356 aa  169  9e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0142848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4259  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  43.16 
 
 
352 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4278  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  38.1 
 
 
418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264378  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4333  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  37.96 
 
 
412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546398  normal  0.109331 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.12 
 
 
418 aa  167  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  38.46 
 
 
321 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4414  inner-membrane translocator  42.81 
 
 
352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1728  inner-membrane translocator  36.5 
 
 
363 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4393  inner-membrane translocator  42.96 
 
 
352 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4921  inner-membrane translocator  36.71 
 
 
433 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0573712  decreased coverage  0.000000000000182248 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2140  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  38.72 
 
 
423 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0895739  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1139  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  37.76 
 
 
418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1173  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  37.76 
 
 
418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.907427 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0774  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  38.72 
 
 
427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0864  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  38.72 
 
 
427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0137433  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1390  inner-membrane translocator  35.15 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0599  inner-membrane translocator  36.08 
 
 
437 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.577839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1156  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  37.76 
 
 
418 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652627  normal  0.0268072 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0653  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.73 
 
 
423 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4657  inner-membrane translocator  36.39 
 
 
433 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.123215  decreased coverage  0.00142103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  38.54 
 
 
372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1067  inner-membrane translocator  37.5 
 
 
346 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0499919  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1750  inner-membrane translocator  34.76 
 
 
452 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40589  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1035  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.38 
 
 
350 aa  163  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.977456  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4430  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  40.07 
 
 
423 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  hitchhiker  0.00013336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2500  inner-membrane translocator  36.75 
 
 
407 aa  162  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.62609  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4917  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein BraE  36.08 
 
 
437 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.875772  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3027  inner-membrane translocator  35.28 
 
 
393 aa  162  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  0.739943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4945  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.73 
 
 
423 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.487918  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5270  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.39 
 
 
423 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1160  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.85 
 
 
350 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.625358  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  36.74 
 
 
353 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3350  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.39 
 
 
423 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5017  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.39 
 
 
423 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  35.01 
 
 
357 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  33.99 
 
 
389 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  33.99 
 
 
389 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  33.99 
 
 
389 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  32.72 
 
 
389 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  35.18 
 
 
321 aa  160  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26110  ABC-transporter permease protein  38.76 
 
 
424 aa  160  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0693471  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.42 
 
 
389 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  32.96 
 
 
389 aa  159  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.15 
 
 
389 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1113  branched-chain amino-acid ABC transporter, permease protein  35.67 
 
 
343 aa  159  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0858  inner-membrane translocator  35.53 
 
 
345 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1471  inner-membrane translocator  34.48 
 
 
376 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.959824  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  35.28 
 
 
389 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 
389 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 
389 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.73 
 
 
389 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.73 
 
 
389 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0772  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.22 
 
 
350 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.136837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.73 
 
 
389 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  36.57 
 
 
443 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.73 
 
 
389 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0267  inner-membrane translocator  35.26 
 
 
357 aa  157  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000311573  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.21 
 
 
389 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>