More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2430 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2430  inner-membrane translocator  100 
 
 
340 aa  666    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.106551  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0462  inner-membrane translocator  53.69 
 
 
331 aa  324  1e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  44.87 
 
 
326 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  39.94 
 
 
401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2500  inner-membrane translocator  41.8 
 
 
317 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0934  inner-membrane translocator  42.53 
 
 
327 aa  227  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000511533  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1386  inner-membrane translocator  43.64 
 
 
312 aa  223  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3534  inner-membrane translocator  45.02 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2554  inner-membrane translocator  42.86 
 
 
322 aa  220  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1893  branched-chain amino acid ABC transporter permease  41.56 
 
 
362 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00991478  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  37.99 
 
 
324 aa  215  9e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1580  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.32 
 
 
317 aa  204  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.571371  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 
307 aa  202  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  41.8 
 
 
297 aa  202  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4924  inner-membrane translocator  39.71 
 
 
358 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  40.51 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2016  inner-membrane translocator  41.02 
 
 
318 aa  199  7.999999999999999e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2308  inner-membrane translocator  38.08 
 
 
372 aa  196  5.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1608  inner-membrane translocator  35.01 
 
 
356 aa  193  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0142848  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1471  inner-membrane translocator  37.47 
 
 
353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0927911  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1674  inner-membrane translocator  34.17 
 
 
358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2111  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.69 
 
 
298 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1390  inner-membrane translocator  36.65 
 
 
334 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0267  inner-membrane translocator  38.53 
 
 
357 aa  187  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000311573  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0613  inner-membrane translocator  36.02 
 
 
345 aa  186  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4414  inner-membrane translocator  41.83 
 
 
359 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.743887  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2933  inner-membrane translocator  35.73 
 
 
356 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2271  inner-membrane translocator  39.1 
 
 
297 aa  186  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.900398 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0400  ABC transporter permease  40.92 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4259  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  42.68 
 
 
352 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  34.33 
 
 
407 aa  182  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4414  inner-membrane translocator  42.55 
 
 
352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4393  inner-membrane translocator  43.92 
 
 
352 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  39.65 
 
 
299 aa  179  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0612  inner-membrane translocator  38.94 
 
 
347 aa  178  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1164  inner-membrane translocator  36.47 
 
 
358 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  36.14 
 
 
415 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0637  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
347 aa  178  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000477005  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0482  ABC transporter permease  37.43 
 
 
324 aa  176  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1471  inner-membrane translocator  34.98 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.959824  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  34.9 
 
 
407 aa  173  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.34 
 
 
339 aa  171  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1067  inner-membrane translocator  37.21 
 
 
346 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0499919  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0564  inner-membrane translocator  35.56 
 
 
358 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00158487  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0858  inner-membrane translocator  33.75 
 
 
345 aa  170  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3103  inner-membrane translocator  34.67 
 
 
340 aa  169  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1113  branched-chain amino-acid ABC transporter, permease protein  34.66 
 
 
343 aa  167  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0477  inner-membrane translocator  33.62 
 
 
345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000104814  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  34.59 
 
 
372 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  36.45 
 
 
423 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1160  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.38 
 
 
350 aa  166  8e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.625358  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0772  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.77 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.136837  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1173  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  37.01 
 
 
418 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.907427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  35.64 
 
 
321 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1139  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  37.01 
 
 
418 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4278  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  37.01 
 
 
418 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264378  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1156  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  37.01 
 
 
418 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652627  normal  0.0268072 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.73 
 
 
418 aa  162  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1035  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.77 
 
 
350 aa  162  9e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.977456  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4333  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  36.27 
 
 
412 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546398  normal  0.109331 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  34.21 
 
 
443 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  34.93 
 
 
389 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2494  inner-membrane translocator  34.6 
 
 
463 aa  159  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4305  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  35.69 
 
 
417 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  33.69 
 
 
389 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2500  inner-membrane translocator  35.24 
 
 
407 aa  158  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.62609  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  36.16 
 
 
418 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  34.88 
 
 
389 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  34.88 
 
 
389 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  34.88 
 
 
389 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  34.03 
 
 
389 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  35.4 
 
 
327 aa  156  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50540  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  35.69 
 
 
417 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0377625 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1876  inner-membrane translocator  35.8 
 
 
358 aa  156  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.255765  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  35.09 
 
 
389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.01 
 
 
389 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.01 
 
 
389 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.01 
 
 
389 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.01 
 
 
389 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.01 
 
 
389 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.01 
 
 
389 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3514  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  34.88 
 
 
463 aa  156  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.72 
 
 
389 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3847  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  35.5 
 
 
421 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0194014  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1385  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  35.14 
 
 
423 aa  155  9e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.121753  normal  0.219132 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1750  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
452 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40589  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1728  inner-membrane translocator  34.35 
 
 
363 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3972  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.84 
 
 
428 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.640531  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.87 
 
 
389 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.84 
 
 
428 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  32.89 
 
 
389 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5537  inner-membrane translocator  37.5 
 
 
385 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3327  inner-membrane translocator  34.57 
 
 
463 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.630335 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.4 
 
 
389 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3071  inner-membrane translocator  34.28 
 
 
463 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730301  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.62 
 
 
389 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  32.52 
 
 
389 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3337  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.23 
 
 
423 aa  153  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4110  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.47 
 
 
421 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.015431  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  32.5 
 
 
454 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>