More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3867 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3867  inner-membrane translocator  100 
 
 		 704 aa  1352    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.318133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3489  inner-membrane translocator  37.3 
 
 		 743 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4017  inner-membrane translocator  41.07 
 
 		 697 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8309  inner-membrane translocator  42.68 
 
 		 652 aa  301  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.507178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1980  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component-like protein  32.34 
 
 		 898 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2952  ABC transporter related  35.87 
 
 		 930 aa  227  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3395  ABC transporter related  32.64 
 
 		 956 aa  204  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4737  ABC transporter related  31.73 
 
 		 940 aa  189  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5664  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 741 aa  189  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269421  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2136  ABC transporter related protein  33.51 
 
 		 908 aa  184  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8833  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 637 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.756263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0855  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 772 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.852549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4038  inner-membrane translocator  30.24 
 
 		 816 aa  169  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3859  ABC transporter related protein  33.72 
 
 		 924 aa  167  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4486  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 661 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4564  ABC transporter related  31.4 
 
 		 989 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3222  inner-membrane translocator  28.55 
 
 		 684 aa  147  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5562  ABC transporter related  29.35 
 
 		 891 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3350  inner-membrane translocator  32.1 
 
 		 659 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0381  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 692 aa  132  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 292 aa  125  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  27.94 
 
 		 950 aa  117  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4711  inner-membrane translocator  30.61 
 
 		 292 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1283  ABC transporter related  30.79 
 
 		 1087 aa  112  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.887426  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.62 
 
 		 290 aa  111  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7078  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  32.11 
 
 		 292 aa  110  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  32.1 
 
 		 308 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.1 
 
 		 308 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.1 
 
 		 308 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  31 
 
 		 308 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.63 
 
 		 319 aa  109  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  31 
 
 		 319 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  31 
 
 		 308 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  31 
 
 		 319 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  31 
 
 		 308 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1871  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 308 aa  109  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal  0.0224958 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  31.37 
 
 		 308 aa  108  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  30.63 
 
 		 308 aa  107  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  30.63 
 
 		 308 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4454  inner-membrane translocator  33.98 
 
 		 288 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242993  normal  0.0168386 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0056  ABC transporter, permease protein  36.06 
 
 		 292 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2713  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 		 292 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  32.28 
 
 		 358 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2666  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  35.69 
 
 		 292 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  30.6 
 
 		 302 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3288  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 		 292 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  31.69 
 
 		 308 aa  102  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1839  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 		 292 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  31 
 
 		 308 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  31.69 
 
 		 308 aa  102  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0055  ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 		 292 aa  103  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  34.21 
 
 		 358 aa  102  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  30.63 
 
 		 308 aa  102  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  27.27 
 
 		 603 aa  101  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  26.9 
 
 		 603 aa  101  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  27.26 
 
 		 951 aa  100  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3841  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 294 aa  100  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00122547  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  30.53 
 
 		 302 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4485  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 295 aa  99.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19585  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 294 aa  98.2  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0096  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.33 
 
 		 607 aa  97.4  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  29.67 
 
 		 291 aa  97.4  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  27.52 
 
 		 603 aa  97.1  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  26.53 
 
 		 603 aa  97.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4242  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 292 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  30.21 
 
 		 302 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1742  inner-membrane translocator  30.36 
 
 		 292 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0350501  normal  0.0888724 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  26.53 
 
 		 603 aa  96.3  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.76 
 
 		 325 aa  94.7  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  30.6 
 
 		 291 aa  94.7  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  29.7 
 
 		 294 aa  93.6  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4820  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 290 aa  93.6  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0225289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  27.48 
 
 		 319 aa  92.8  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.31 
 
 		 294 aa  93.2  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1751  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 304 aa  93.2  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48853  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.31 
 
 		 294 aa  92.4  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 302 aa  91.7  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  23.95 
 
 		 300 aa  91.3  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  29.63 
 
 		 338 aa  91.3  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0611  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.67 
 
 		 302 aa  90.5  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0350  inner-membrane translocator  31.3 
 
 		 292 aa  90.5  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.018915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  29 
 
 		 294 aa  90.5  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  29.63 
 
 		 309 aa  89.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0624  inner-membrane translocator  30.3 
 
 		 293 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.568796  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  33.03 
 
 		 321 aa  88.6  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3557  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 292 aa  89  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0268  branched chain amino acid ABC transporter permease  34.26 
 
 		 264 aa  87.8  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  29.26 
 
 		 309 aa  88.2  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  30.23 
 
 		 293 aa  88.2  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1003  inner-membrane translocator  27.81 
 
 		 290 aa  87.8  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  29.78 
 
 		 309 aa  87.8  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5148  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  33.06 
 
 		 351 aa  87.8  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  27.94 
 
 		 309 aa  87  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0505  inner-membrane translocator  27.61 
 
 		 293 aa  87.4  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0978839  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4216  inner-membrane translocator  26.48 
 
 		 630 aa  87  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3507  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 373 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0048  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.73 
 
 		 264 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  29.09 
 
 		 309 aa  87  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  32.13 
 
 		 663 aa  87  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3323  inner-membrane translocator  29.12 
 
 		 309 aa  87  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>