More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_2713 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1839  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 
292 aa  554  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2666  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 
292 aa  554  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0055  ABC transporter, permease protein  99.66 
 
 
292 aa  554  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3288  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 
292 aa  554  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2713  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 
292 aa  554  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0056  ABC transporter, permease protein  99.66 
 
 
292 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0268  branched chain amino acid ABC transporter permease  99.62 
 
 
264 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0048  branched chain amino acid ABC transporter permease  94.7 
 
 
264 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4454  inner-membrane translocator  57.19 
 
 
288 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242993  normal  0.0168386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5664  inner-membrane translocator  36.05 
 
 
741 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269421  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2538  inner-membrane translocator  35.56 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0855  inner-membrane translocator  35.45 
 
 
772 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.852549  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  29.35 
 
 
291 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2989  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.34 
 
 
293 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115957  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1174  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.14 
 
 
289 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2545  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.68 
 
 
293 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.322886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  31.87 
 
 
293 aa  99.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7507  ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 
290 aa  99  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43530  amino acid ABC transporter-like protein  30.22 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0533478  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1871  inner-membrane translocator  30.53 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal  0.0224958 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  29.5 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  28.89 
 
 
308 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.89 
 
 
308 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.89 
 
 
308 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.3 
 
 
319 aa  95.9  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2136  ABC transporter related protein  36.96 
 
 
908 aa  95.9  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7157  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  28.37 
 
 
293 aa  95.9  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  28.01 
 
 
308 aa  95.5  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3867  inner-membrane translocator  33.58 
 
 
704 aa  95.9  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.318133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  28.3 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3492  inner-membrane translocator  32.67 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3395  ABC transporter related  32.19 
 
 
956 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  29.12 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3800  inner-membrane translocator  32.67 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.469116  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2113  inner-membrane translocator  33.21 
 
 
302 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.216632  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  27.65 
 
 
308 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  28.3 
 
 
308 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  27.65 
 
 
319 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  27.65 
 
 
319 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  27.65 
 
 
308 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3874  inner-membrane translocator  32.27 
 
 
293 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  30.62 
 
 
290 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4486  inner-membrane translocator  32.08 
 
 
661 aa  92.4  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  28.07 
 
 
308 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3010  inner-membrane translocator  27.31 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000508141  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2986  inner-membrane translocator  29.68 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286251  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2768  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  29.68 
 
 
293 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0848238  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4711  inner-membrane translocator  28.63 
 
 
292 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  26.77 
 
 
291 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  28.19 
 
 
293 aa  90.1  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43770  inner-membrane translocator  29.96 
 
 
293 aa  89.7  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150883  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  30.15 
 
 
308 aa  89.7  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  30.15 
 
 
308 aa  89.7  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  29.17 
 
 
297 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2749  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  28.99 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0611972  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.64 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  29.96 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1544  inner-membrane translocator  30.63 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3004  inner-membrane translocator  28.99 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.961727  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0251  inner-membrane translocator  28.92 
 
 
304 aa  87.4  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.477771  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.64 
 
 
298 aa  87.4  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  33.46 
 
 
289 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1980  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component-like protein  30.1 
 
 
898 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755596  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.08 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  26.42 
 
 
292 aa  86.7  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  26.85 
 
 
319 aa  86.3  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3859  ABC transporter related protein  30.45 
 
 
924 aa  86.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.44 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  26.74 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  28.14 
 
 
303 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  28.73 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3304  inner-membrane translocator  34.25 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3966  inner-membrane translocator  30.8 
 
 
382 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  26.67 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  27.78 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3202  inner-membrane translocator  30.45 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3836  inner-membrane translocator  33.47 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1051  inner-membrane translocator  31.05 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3489  inner-membrane translocator  32.36 
 
 
743 aa  83.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4737  ABC transporter related  27.42 
 
 
940 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1604  inner-membrane translocator  27.61 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1579  inner-membrane translocator  27.61 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4017  inner-membrane translocator  31.15 
 
 
697 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3583  inner-membrane translocator  29.86 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.967515  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  25.44 
 
 
298 aa  82.4  0.000000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  25.52 
 
 
542 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4415  inner-membrane translocator  28.53 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.550314  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  28.85 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  26.62 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3459  inner-membrane translocator  30.24 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.411869  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1838  inner-membrane translocator  29.75 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  28 
 
 
547 aa  81.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  28.77 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4564  ABC transporter related  29.28 
 
 
989 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4177  inner-membrane translocator  28.35 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2201  inner-membrane translocator  27.67 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.796899  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  27.84 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  28.24 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  26.45 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  30.08 
 
 
548 aa  79.3  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.205797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>