More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0048 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I0048  branched chain amino acid ABC transporter permease  100 
 
 		 264 aa  502  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0268  branched chain amino acid ABC transporter permease  95.08 
 
 		 264 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3288  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  94.7 
 
 		 292 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2666  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  94.7 
 
 		 292 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1839  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  94.7 
 
 		 292 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0056  ABC transporter, permease protein  94.32 
 
 		 292 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0055  ABC transporter, permease protein  94.32 
 
 		 292 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2713  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  94.7 
 
 		 292 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4454  inner-membrane translocator  53.31 
 
 		 288 aa  228  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242993  normal  0.0168386 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2538  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5664  inner-membrane translocator  34.34 
 
 		 741 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269421  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1174  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.62 
 
 		 289 aa  95.5  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  30.37 
 
 		 308 aa  92  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30 
 
 		 319 aa  92  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.37 
 
 		 308 aa  92  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.37 
 
 		 308 aa  92  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7507  ABC transporter, permease protein  32.66 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  30 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  30 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  29.26 
 
 		 308 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  30 
 
 		 308 aa  89.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  29.26 
 
 		 319 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  29.26 
 
 		 308 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  29.26 
 
 		 319 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2989  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.65 
 
 		 293 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115957  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 308 aa  89.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43530  amino acid ABC transporter-like protein  30.2 
 
 		 293 aa  88.6  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0533478  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1871  inner-membrane translocator  31.03 
 
 		 308 aa  87.4  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal  0.0224958 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7157  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  28.3 
 
 		 293 aa  87  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 293 aa  87  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0855  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 772 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.852549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  29.5 
 
 		 308 aa  85.9  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2113  inner-membrane translocator  32.93 
 
 		 302 aa  85.9  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.216632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3867  inner-membrane translocator  33.51 
 
 		 704 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.318133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2768  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  29.62 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0848238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2986  inner-membrane translocator  29.62 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  26.6 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4711  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43770  inner-membrane translocator  29.23 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150883  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  27.49 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2545  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.39 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.322886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  29.23 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2749  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  28.52 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0611972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3004  inner-membrane translocator  27.88 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.961727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0802  inner-membrane translocator  30.46 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0251  inner-membrane translocator  28.36 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.477771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  30 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1604  inner-membrane translocator  26.84 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3800  inner-membrane translocator  30.7 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.469116  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  30 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3492  inner-membrane translocator  30.7 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1579  inner-membrane translocator  26.84 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3304  inner-membrane translocator  34.21 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  29.61 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4737  ABC transporter related  26.76 
 
 		 940 aa  75.5  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  28.35 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  28.8 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.05 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3874  inner-membrane translocator  30.26 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.05 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3489  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 743 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  28.96 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1437  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522267  hitchhiker  0.00000379274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  29.1 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0601  inner-membrane translocator  31.11 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2201  inner-membrane translocator  27.56 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.796899  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3966  inner-membrane translocator  32.11 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3010  inner-membrane translocator  25 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000508141  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2136  ABC transporter related protein  35.32 
 
 		 908 aa  72.4  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.85 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3836  inner-membrane translocator  32.22 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3831  inner-membrane translocator  31 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3336  inner-membrane translocator  27.16 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2696  inner-membrane translocator  26.62 
 
 		 554 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.665567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  25.33 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4185  inner-membrane translocator  27.65 
 
 		 537 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.940988  normal  0.195326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  24.68 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  26.84 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  28.46 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2006  inner-membrane translocator  40.35 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4017  inner-membrane translocator  32.72 
 
 		 697 aa  70.5  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1051  inner-membrane translocator  29.78 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  27.76 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  25.38 
 
 		 542 aa  70.1  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1163  inner-membrane translocator  29.26 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2723  inner-membrane translocator  29.46 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.956007  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1797  inner-membrane translocator  29.69 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.160989 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  28.88 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1751  inner-membrane translocator  27.46 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1980  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component-like protein  28.87 
 
 		 898 aa  68.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3859  ABC transporter related protein  29.88 
 
 		 924 aa  68.9  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3609  inner-membrane translocator  28.21 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.566086 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  29.2 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4297  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.07 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315349  decreased coverage  0.00178163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1420  inner-membrane translocator  29.89 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>