More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4378 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4378  inner-membrane translocator  100 
 
 		 294 aa  549  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4485  inner-membrane translocator  48.12 
 
 		 295 aa  248  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2639  inner-membrane translocator  51.06 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96958  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2790  inner-membrane translocator  50.51 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.709673  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5342  inner-membrane translocator  43.97 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0863974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  39.93 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6102  inner-membrane translocator  38.23 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  40.21 
 
 		 287 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1066  inner-membrane translocator  38.57 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00641991  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 297 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.46 
 
 		 298 aa  169  5e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.46 
 
 		 298 aa  169  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.14 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.46 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3726  inner-membrane translocator  41.55 
 
 		 300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0694361  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0612  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.11 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  34.12 
 
 		 304 aa  159  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  36.55 
 
 		 293 aa  159  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.33 
 
 		 291 aa  158  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  36.16 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  35.97 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 292 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1675  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 299 aa  156  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.644536  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  36.09 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2866  inner-membrane translocator  36.16 
 
 		 311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1136  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 286 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0602243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 309 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.04 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  35.76 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.76 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4415  inner-membrane translocator  37.9 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.550314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.76 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0759  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000754526 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3552  inner-membrane translocator  37.24 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  36.07 
 
 		 308 aa  152  5e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 291 aa  152  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 338 aa  152  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1470  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000609121  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  35.28 
 
 		 309 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.1 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  35.28 
 
 		 309 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  36.55 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2318  inner-membrane translocator  37.13 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  hitchhiker  0.00247249 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1943  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0473  inner-membrane translocator  32.44 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0636  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000266086  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1609  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171183  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2708  inner-membrane translocator  37.13 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  33.98 
 
 		 309 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3336  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 294 aa  149  7e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  34.85 
 
 		 319 aa  148  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.11 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.94 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  33.75 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.62 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2440  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  36.48 
 
 		 311 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  34.62 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.62 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 302 aa  145  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 		 316 aa  145  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 309 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.75 
 
 		 316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 		 298 aa  145  8.000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  33.56 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  33.11 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1871  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal  0.0224958 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2472  inner-membrane translocator  36.72 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.76 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>