More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2639 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2639  inner-membrane translocator  100 
 
 
292 aa  550  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96958  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4378  inner-membrane translocator  51.06 
 
 
294 aa  259  5.0000000000000005e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5342  inner-membrane translocator  44.41 
 
 
296 aa  232  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0863974  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4485  inner-membrane translocator  45.3 
 
 
295 aa  217  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2790  inner-membrane translocator  48.26 
 
 
295 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.709673  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6102  inner-membrane translocator  36.27 
 
 
300 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401287  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  38.01 
 
 
301 aa  169  7e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0612  inner-membrane translocator  34.84 
 
 
297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 
298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.95 
 
 
298 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  35.79 
 
 
287 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.95 
 
 
298 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  32.24 
 
 
303 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  35.71 
 
 
304 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4918  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein BraD  32.34 
 
 
304 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.49 
 
 
298 aa  157  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  32.04 
 
 
297 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  35.31 
 
 
319 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  35.31 
 
 
319 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  33.66 
 
 
304 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  35.31 
 
 
308 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  35.31 
 
 
308 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  35.31 
 
 
308 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0598  inner-membrane translocator  31.89 
 
 
304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34105  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.31 
 
 
319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  34.21 
 
 
300 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1751  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
304 aa  155  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48853  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  33.66 
 
 
300 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4922  inner-membrane translocator  33 
 
 
304 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.75867  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  34.54 
 
 
300 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4658  inner-membrane translocator  32.89 
 
 
304 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026431 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4866  inner-membrane translocator  32.67 
 
 
304 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  hitchhiker  0.000815383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4744  inner-membrane translocator  32.67 
 
 
304 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579328  hitchhiker  0.000000155208 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  34.98 
 
 
308 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  34.65 
 
 
308 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  33.9 
 
 
293 aa  153  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
308 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
308 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  34.98 
 
 
308 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3328  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
300 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166964  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64890  putative permease of ABC branched chain amino acid transporter  31.46 
 
 
304 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0553  inner-membrane translocator  32.56 
 
 
304 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0455233  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  32.03 
 
 
308 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1066  inner-membrane translocator  31.6 
 
 
297 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00641991  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1871  inner-membrane translocator  35.08 
 
 
308 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal  0.0224958 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  32.79 
 
 
316 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  33.98 
 
 
316 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  33.98 
 
 
316 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.77 
 
 
316 aa  149  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  33.98 
 
 
316 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  33.98 
 
 
316 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  33.98 
 
 
316 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  35.41 
 
 
311 aa  148  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  33.98 
 
 
316 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  33.98 
 
 
316 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  33.77 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.77 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3323  inner-membrane translocator  33.12 
 
 
309 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  33.56 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.77 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  35.2 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19640  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, permease component  37.13 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0105896  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  37.21 
 
 
319 aa  146  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4109  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.95 
 
 
307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.180327  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.66 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3202  inner-membrane translocator  35.08 
 
 
338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3846  inner-membrane translocator  36.01 
 
 
307 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221591  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.44 
 
 
316 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  35.07 
 
 
291 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  35.08 
 
 
308 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  32.67 
 
 
308 aa  145  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26120  ABC-transporter permease protein  32.57 
 
 
304 aa  145  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000346731  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1136  inner-membrane translocator  34.74 
 
 
286 aa  145  9e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0602243  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1791  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 
302 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1725  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 
302 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
308 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
308 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.45 
 
 
291 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5637  branched chain amino acid ABC transporter permease  31.46 
 
 
304 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  32.67 
 
 
308 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4304  branched-chain amino acid transport protein BraD  36.3 
 
 
307 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  33.55 
 
 
308 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1112  inner-membrane translocator  34.43 
 
 
302 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  32.98 
 
 
300 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  32.66 
 
 
301 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  35.1 
 
 
338 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3726  inner-membrane translocator  36.73 
 
 
300 aa  143  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0694361  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3336  inner-membrane translocator  34.1 
 
 
307 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50530  branched-chain amino acid transport protein BraD  35.97 
 
 
307 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0142776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1247  inner-membrane translocator  35.2 
 
 
307 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  34.29 
 
 
309 aa  142  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  31.13 
 
 
308 aa  142  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.42 
 
 
316 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  32.9 
 
 
308 aa  142  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  31.85 
 
 
300 aa  142  8e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3754  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  32.57 
 
 
308 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3832  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  32.57 
 
 
308 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377986  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3934  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  32.57 
 
 
308 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3875  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  32.57 
 
 
308 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  31.92 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>