More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2790 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2790  inner-membrane translocator  100 
 
 
295 aa  556  1e-157  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.709673  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4378  inner-membrane translocator  50.51 
 
 
294 aa  264  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4485  inner-membrane translocator  46.1 
 
 
295 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2639  inner-membrane translocator  48.26 
 
 
292 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96958  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5342  inner-membrane translocator  42.46 
 
 
296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0863974  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  40.46 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.44 
 
 
298 aa  193  4e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.68 
 
 
298 aa  193  4e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.44 
 
 
298 aa  192  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.1 
 
 
298 aa  190  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  35.19 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1066  inner-membrane translocator  38.75 
 
 
297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00641991  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3726  inner-membrane translocator  43.29 
 
 
300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0694361  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  37.8 
 
 
292 aa  182  7e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  38.49 
 
 
293 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0612  inner-membrane translocator  35.71 
 
 
297 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  37.41 
 
 
300 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6102  inner-membrane translocator  37.46 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401287  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1675  inner-membrane translocator  38.57 
 
 
299 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.644536  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.44 
 
 
298 aa  177  2e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  37.41 
 
 
291 aa  177  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  36.14 
 
 
287 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1609  inner-membrane translocator  38.31 
 
 
299 aa  172  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171183  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  38.31 
 
 
294 aa  168  8e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  32.99 
 
 
300 aa  169  8e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 
293 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  37.76 
 
 
290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  36.52 
 
 
304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.79 
 
 
308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  36.79 
 
 
308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.79 
 
 
308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  34.74 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  36.79 
 
 
308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  36.79 
 
 
308 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.79 
 
 
319 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  36.79 
 
 
308 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  36.79 
 
 
308 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  36.79 
 
 
319 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  36.79 
 
 
319 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4394  inner-membrane translocator  37.26 
 
 
310 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4415  inner-membrane translocator  37.26 
 
 
310 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 
289 aa  160  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  35.45 
 
 
308 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.83 
 
 
291 aa  160  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  35.96 
 
 
292 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4260  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  37.58 
 
 
310 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4415  inner-membrane translocator  39.17 
 
 
309 aa  158  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.550314  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  32.76 
 
 
293 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  36.75 
 
 
308 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3336  inner-membrane translocator  35.81 
 
 
307 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  36.16 
 
 
309 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0563  inner-membrane translocator  34.65 
 
 
306 aa  155  8e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0182389  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  34.92 
 
 
308 aa  154  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0734  inner-membrane translocator  35.56 
 
 
324 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.993171  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0636  inner-membrane translocator  34.36 
 
 
297 aa  154  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000266086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3104  inner-membrane translocator  32.79 
 
 
310 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  34.88 
 
 
301 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  37.25 
 
 
309 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  35.88 
 
 
308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1871  inner-membrane translocator  36.75 
 
 
308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal  0.0224958 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  35.29 
 
 
338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  34.22 
 
 
308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  36.96 
 
 
335 aa  152  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1470  inner-membrane translocator  35.62 
 
 
303 aa  151  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000609121  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  34.69 
 
 
294 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  34.01 
 
 
302 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  36.6 
 
 
309 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  33.11 
 
 
308 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  33.11 
 
 
308 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  35.99 
 
 
316 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  34.97 
 
 
309 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.91 
 
 
291 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  34.22 
 
 
301 aa  149  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1165  inner-membrane translocator  32.34 
 
 
306 aa  149  7e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.893809 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0521  inner-membrane translocator  32.78 
 
 
304 aa  149  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  34.75 
 
 
302 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  35.52 
 
 
542 aa  149  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  35.29 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  36.6 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  35.29 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  31.51 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  33.77 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  35.58 
 
 
319 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1751  inner-membrane translocator  32.89 
 
 
304 aa  146  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48853  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  37.41 
 
 
290 aa  147  3e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000179103 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  36.1 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2115  inner-membrane translocator  32.67 
 
 
304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  33.99 
 
 
308 aa  146  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.02 
 
 
316 aa  145  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0466  inner-membrane translocator  32.91 
 
 
316 aa  145  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0964978  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  37.5 
 
 
291 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0759  inner-membrane translocator  36.48 
 
 
311 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000754526 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
300 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3323  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
309 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.7 
 
 
316 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.79 
 
 
299 aa  144  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0598  inner-membrane translocator  32.35 
 
 
304 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34105  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  34.7 
 
 
316 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.7 
 
 
316 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>