More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1863 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1863  inner-membrane translocator  100 
 
 		 356 aa  705    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0299  inner-membrane translocator  67.51 
 
 		 357 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.658484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2306  inner-membrane translocator  68.07 
 
 		 357 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4178  inner-membrane translocator  64.15 
 
 		 357 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.983484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5717  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  65.14 
 
 		 357 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4574  inner-membrane translocator  65.27 
 
 		 357 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2608  inner-membrane translocator  63.92 
 
 		 357 aa  421  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1567  inner-membrane translocator  64.25 
 
 		 357 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394848  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000401  branched-chain amino acid transport system permease protein livM  61.62 
 
 		 355 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.241122  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3507  inner-membrane translocator  60.32 
 
 		 373 aa  414  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3134  inner-membrane translocator  63.35 
 
 		 357 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.628981  normal  0.885727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3414  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  59.94 
 
 		 357 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1834  inner-membrane translocator  61.9 
 
 		 357 aa  403  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1557  inner-membrane translocator  64.53 
 
 		 357 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.505429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2284  inner-membrane translocator  41.76 
 
 		 349 aa  271  9e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98813  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  42.21 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  41.93 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  41.93 
 
 		 350 aa  261  1e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  46.42 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2426  inner-membrane translocator  42.66 
 
 		 352 aa  236  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  40.17 
 
 		 345 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  39.2 
 
 		 348 aa  233  5e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0543  inner-membrane translocator  42.54 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0625  inner-membrane translocator  41.24 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  41.04 
 
 		 345 aa  229  7e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  39.43 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  38.24 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2722  inner-membrane translocator  39.84 
 
 		 358 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285208  normal  0.425385 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0252  inner-membrane translocator  39.11 
 
 		 358 aa  219  6e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.231195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0217  inner-membrane translocator  40 
 
 		 358 aa  219  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0263  inner-membrane translocator  39.72 
 
 		 358 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 358 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5009  inner-membrane translocator  38.02 
 
 		 354 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 381 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0379  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livM  39.84 
 
 		 358 aa  200  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0051  inner-membrane translocator  38.12 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  37.21 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3362  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2276  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.29 
 
 		 358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.158559  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0951  inner-membrane translocator  39.29 
 
 		 358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4939  inner-membrane translocator  40.69 
 
 		 358 aa  195  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1156  inner-membrane translocator  35.46 
 
 		 354 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.412429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0601  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0138  inner-membrane translocator  36.94 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2220  inner-membrane translocator  39.39 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120044  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4005  inner-membrane translocator  39.84 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2374  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0467  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 358 aa  188  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193008  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0458  inner-membrane translocator  37.22 
 
 		 358 aa  188  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.441083  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3610  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963885  normal  0.413755 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2440  inner-membrane translocator  36.23 
 
 		 356 aa  187  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0118  inner-membrane translocator  38.4 
 
 		 358 aa  185  8e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3539  inner-membrane translocator  37.47 
 
 		 358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.17747  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3437  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1545  inner-membrane translocator  37.22 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.137578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43520  amino acid ABC transporter-like protein  36.13 
 
 		 355 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00847282  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0551  inner-membrane translocator  35.21 
 
 		 355 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.340472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  41.09 
 
 		 325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3011  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152809  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  37.35 
 
 		 562 aa  168  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2988  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.87 
 
 		 355 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.475714  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5289  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.975087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5148  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  37.76 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0784  inner-membrane translocator  35.26 
 
 		 354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5036  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 362 aa  166  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3003  inner-membrane translocator  38.75 
 
 		 354 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2750  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  38.44 
 
 		 354 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0351  inner-membrane translocator  39.18 
 
 		 345 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0132915  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1652  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2738  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 360 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7158  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  38.66 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.258104  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  33.88 
 
 		 321 aa  155  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1850  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 337 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3688  inner-membrane translocator  38.85 
 
 		 330 aa  152  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3558  inner-membrane translocator  38.63 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.288511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3103  inner-membrane translocator  36.82 
 
 		 354 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43760  LivM family inner-membrane translocator  39.94 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.205767  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0366  inner-membrane translocator  34.4 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000392686  unclonable  0.0000000558621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1741  inner-membrane translocator  37.86 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0493356  normal  0.156459 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1004  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  37.45 
 
 		 315 aa  146  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4296  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.5 
 
 		 351 aa  145  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258747  decreased coverage  0.00201809 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  35.57 
 
 		 335 aa  145  9e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  31.96 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4243  inner-membrane translocator  37.73 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1463  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 358 aa  143  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 317 aa  143  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3801  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 347 aa  143  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  37.35 
 
 		 319 aa  142  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  30.89 
 
 		 358 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1517  inner-membrane translocator  33.98 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.51 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2711  inner-membrane translocator  30.57 
 
 		 358 aa  139  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 327 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7079  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livM  37.45 
 
 		 338 aa  139  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.867419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  34.12 
 
 		 571 aa  139  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  33.33 
 
 		 614 aa  139  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>