More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5600 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5600  ABC transporter related protein  100 
 
 		 235 aa  462  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  66.81 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  49.36 
 
 		 236 aa  249  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  52.56 
 
 		 260 aa  248  6e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_003296  RS01989  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  54.81 
 
 		 241 aa  247  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  49.57 
 
 		 236 aa  244  8e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 237 aa  242  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.5 
 
 		 235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3797  ABC transporter related  53.56 
 
 		 241 aa  241  6e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166271 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3910  ABC transporter related  53.56 
 
 		 241 aa  241  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5351  ABC transporter related  52.79 
 
 		 248 aa  241  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  50.83 
 
 		 251 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  51.5 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  51.07 
 
 		 242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  51.5 
 
 		 242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  50 
 
 		 256 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  50.85 
 
 		 239 aa  236  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  47.01 
 
 		 237 aa  235  3e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  51.93 
 
 		 245 aa  235  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  49.57 
 
 		 249 aa  234  6e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  50.43 
 
 		 235 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  49.79 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  49.79 
 
 		 265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  49.37 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  47.64 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 		 236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  50.21 
 
 		 242 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  47.23 
 
 		 236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  50.85 
 
 		 237 aa  231  5e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  50.21 
 
 		 242 aa  232  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  48.95 
 
 		 239 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  50.85 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  52.79 
 
 		 237 aa  230  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  50 
 
 		 243 aa  230  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  47.44 
 
 		 234 aa  231  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  47.26 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2940  ABC transporter related  48.51 
 
 		 255 aa  229  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0524506  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  47.62 
 
 		 238 aa  229  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  49.15 
 
 		 234 aa  229  4e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  45.3 
 
 		 234 aa  228  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  50 
 
 		 237 aa  228  6e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  50 
 
 		 247 aa  228  7e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  45.92 
 
 		 235 aa  228  8e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4524  ABC transporter related  47.9 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180068  normal  0.792034 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4656  ABC transporter related  47.9 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114918 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  48.93 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01742  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  48.12 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.823741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  50 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  50.65 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  48.95 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0506  ABC transporter related  43.72 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00971431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.42 
 
 		 235 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.1 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.1 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.1 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  47.64 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.1 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.1 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  45.99 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.07 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  48.51 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  47.21 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  48.95 
 
 		 238 aa  225  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  47.68 
 
 		 238 aa  225  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  46.61 
 
 		 253 aa  225  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  48.29 
 
 		 237 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.57 
 
 		 238 aa  225  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  48.32 
 
 		 247 aa  224  8e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  45.15 
 
 		 238 aa  224  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  47.01 
 
 		 237 aa  224  8e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  47.41 
 
 		 233 aa  224  8e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  47.64 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  48.07 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  48.31 
 
 		 244 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.73 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  46.84 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  47.06 
 
 		 247 aa  223  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1890  ABC transporter related  50 
 
 		 239 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  48.28 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  44.73 
 
 		 238 aa  223  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  46.84 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  44.73 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  50.86 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.84 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  45.3 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  48.52 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  44.73 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  48.52 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.73 
 
 		 238 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  50.21 
 
 		 236 aa  222  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.73 
 
 		 238 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  45.99 
 
 		 247 aa  222  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.73 
 
 		 238 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.73 
 
 		 238 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.73 
 
 		 238 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.73 
 
 		 238 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  51.28 
 
 		 236 aa  222  3e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  47.44 
 
 		 234 aa  223  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  47.46 
 
 		 239 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  48.95 
 
 		 247 aa  222  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>