More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1841 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1841  ABC transporter related  100 
 
 		 263 aa  520  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  46.61 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  48.93 
 
 		 234 aa  227  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  48.93 
 
 		 239 aa  223  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  44.83 
 
 		 233 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  49.79 
 
 		 235 aa  222  4.9999999999999996e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  45.92 
 
 		 236 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  48.48 
 
 		 237 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.83 
 
 		 235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  48.28 
 
 		 233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  48.07 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  48.74 
 
 		 247 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  45.26 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  46.15 
 
 		 234 aa  218  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  47.21 
 
 		 234 aa  218  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  44.21 
 
 		 234 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  48.73 
 
 		 258 aa  218  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  48.32 
 
 		 247 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  48.32 
 
 		 247 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  46.15 
 
 		 234 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  48.5 
 
 		 235 aa  218  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  44.26 
 
 		 242 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.73 
 
 		 236 aa  217  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  45.8 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  49.37 
 
 		 237 aa  217  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0383  ABC transporter related  49.14 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  47.9 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  47.44 
 
 		 249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 		 234 aa  215  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 		 234 aa  215  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  48.32 
 
 		 237 aa  215  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  47.86 
 
 		 256 aa  215  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  46.86 
 
 		 257 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  45.76 
 
 		 259 aa  214  9e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  48.39 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  47.68 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  47.21 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  47.3 
 
 		 242 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  48.29 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.92 
 
 		 234 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  44.3 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  48.72 
 
 		 264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  44.96 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  44.87 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  47.44 
 
 		 234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  47.21 
 
 		 244 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  49.14 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  49.14 
 
 		 237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  46.78 
 
 		 235 aa  213  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  46.15 
 
 		 235 aa  213  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  46.61 
 
 		 253 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  46.06 
 
 		 239 aa  211  7e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1863  ABC transporter related  47.86 
 
 		 238 aa  211  9e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  47.28 
 
 		 694 aa  211  9e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  45.9 
 
 		 243 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.64 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  46.19 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  46.35 
 
 		 234 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  45.11 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4098  ABC transporter related  45.96 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  47.01 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  45.49 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  46.58 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  46.41 
 
 		 265 aa  208  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  47.01 
 
 		 237 aa  208  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  44.64 
 
 		 236 aa  208  6e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  45.83 
 
 		 240 aa  208  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  46.35 
 
 		 234 aa  208  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  44.44 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  43.59 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  46.38 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  43.28 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  44.64 
 
 		 235 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  45.69 
 
 		 234 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  44.44 
 
 		 234 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  44.17 
 
 		 240 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1444  ABC transporter related  45.49 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  47.41 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  49.36 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  44.67 
 
 		 244 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0575  ABC transporter related  47.5 
 
 		 248 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.96 
 
 		 247 aa  205  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.26 
 
 		 244 aa  205  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  44.68 
 
 		 231 aa  205  6e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  46.64 
 
 		 247 aa  205  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  45.3 
 
 		 256 aa  205  7e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.19 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  45.99 
 
 		 246 aa  205  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  43.7 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  47.23 
 
 		 237 aa  205  8e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  45.11 
 
 		 241 aa  204  9e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  45.26 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  46.61 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  46.35 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.64 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.26 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  42.19 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  45.06 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  42.19 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>