More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1405 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  73.1 
 
 		 447 aa  689    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  100 
 
 		 694 aa  1422    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0379  phenylacetate--CoA ligase  62.15 
 
 		 432 aa  583  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  60.32 
 
 		 433 aa  556  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  58 
 
 		 433 aa  538  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2452  phenylacetate--CoA ligase  58.92 
 
 		 432 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  56.78 
 
 		 429 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1721  Phenylacetate--CoA ligase  56.07 
 
 		 431 aa  498  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  55.79 
 
 		 433 aa  491  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2338  Phenylacetate--CoA ligase  50.93 
 
 		 426 aa  452  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  52.26 
 
 		 427 aa  441  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  53.35 
 
 		 414 aa  439  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  51.57 
 
 		 438 aa  436  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  51.99 
 
 		 415 aa  430  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  52.61 
 
 		 414 aa  432  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  52.11 
 
 		 414 aa  429  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  52.81 
 
 		 435 aa  425  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  52.11 
 
 		 415 aa  422  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  48.83 
 
 		 412 aa  410  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  48.12 
 
 		 428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  47.96 
 
 		 413 aa  398  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  47.26 
 
 		 413 aa  383  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  46.67 
 
 		 412 aa  383  1e-105  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  41.67 
 
 		 438 aa  343  5.999999999999999e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  42.76 
 
 		 446 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  39.91 
 
 		 433 aa  341  2e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  42.24 
 
 		 437 aa  340  5e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  41.44 
 
 		 432 aa  340  5e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  42.69 
 
 		 435 aa  339  8e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  41.09 
 
 		 434 aa  339  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  42.99 
 
 		 433 aa  339  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  42.92 
 
 		 434 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  40.95 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  41.04 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  42.69 
 
 		 434 aa  335  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  41.47 
 
 		 435 aa  335  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  43.94 
 
 		 433 aa  334  3e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  43.33 
 
 		 444 aa  334  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  42.01 
 
 		 432 aa  333  5e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  41.94 
 
 		 434 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  41.71 
 
 		 435 aa  333  9e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  40.14 
 
 		 436 aa  332  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  40.8 
 
 		 437 aa  331  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  40.8 
 
 		 437 aa  331  3e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  40.8 
 
 		 437 aa  330  4e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  40.8 
 
 		 437 aa  330  4e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  39.9 
 
 		 435 aa  331  4e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  40.71 
 
 		 434 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  40.43 
 
 		 432 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  40.62 
 
 		 431 aa  330  5.0000000000000004e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  40.48 
 
 		 432 aa  330  6e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  40.48 
 
 		 432 aa  329  8e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  42.52 
 
 		 433 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  40.37 
 
 		 430 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  40.97 
 
 		 439 aa  328  2.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  43.47 
 
 		 435 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  40.83 
 
 		 445 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26570  phenylacetate-CoA ligase  40.7 
 
 		 448 aa  327  6e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.123505 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  40.43 
 
 		 431 aa  326  9e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  41.71 
 
 		 434 aa  326  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  41.35 
 
 		 433 aa  326  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  39.29 
 
 		 439 aa  325  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  40.89 
 
 		 436 aa  324  3e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  40.86 
 
 		 434 aa  324  3e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  42.52 
 
 		 434 aa  325  3e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  40.19 
 
 		 433 aa  324  4e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  41.67 
 
 		 444 aa  324  4e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  40.61 
 
 		 432 aa  323  8e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  41.29 
 
 		 444 aa  323  8e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  42.18 
 
 		 434 aa  323  9.000000000000001e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  41.18 
 
 		 440 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  40.95 
 
 		 434 aa  322  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  41.65 
 
 		 435 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  40.85 
 
 		 440 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  41.41 
 
 		 440 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  41.41 
 
 		 440 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  40.84 
 
 		 433 aa  321  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  39.01 
 
 		 433 aa  320  5e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1509  phenylacetate-CoA ligase  41.41 
 
 		 441 aa  320  5e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.047551  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1908  phenylacetate-CoA ligase  40.5 
 
 		 446 aa  320  5e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  41.31 
 
 		 432 aa  320  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  39.72 
 
 		 433 aa  320  5e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  38.95 
 
 		 433 aa  320  6e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  40.94 
 
 		 443 aa  320  6e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  40.24 
 
 		 440 aa  320  7e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  40.47 
 
 		 440 aa  320  7e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  38.05 
 
 		 433 aa  320  7.999999999999999e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  41.31 
 
 		 432 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  40.33 
 
 		 434 aa  319  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  39.95 
 
 		 428 aa  319  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0440  phenylacetate-CoA ligase  40.09 
 
 		 436 aa  319  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  39.24 
 
 		 433 aa  318  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  40.33 
 
 		 448 aa  318  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  41.18 
 
 		 440 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  40.71 
 
 		 431 aa  318  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  38.48 
 
 		 436 aa  318  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  39.67 
 
 		 433 aa  318  2e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  40.52 
 
 		 434 aa  317  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  39.57 
 
 		 436 aa  317  5e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  40.28 
 
 		 434 aa  317  7e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>