More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1569 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  79.21 
 
 		 435 aa  712    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  100 
 
 		 433 aa  888    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  78.55 
 
 		 435 aa  720    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  76.46 
 
 		 435 aa  691    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  70.3 
 
 		 433 aa  655    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  76.44 
 
 		 434 aa  705    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  77.67 
 
 		 434 aa  707    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  76.67 
 
 		 434 aa  708    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  70.3 
 
 		 433 aa  649    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  74.71 
 
 		 433 aa  684    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  67.67 
 
 		 434 aa  629  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  66.59 
 
 		 433 aa  624  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  66.36 
 
 		 435 aa  616  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  65.66 
 
 		 432 aa  604  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  63.97 
 
 		 434 aa  600  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  63.34 
 
 		 435 aa  595  1e-169  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  63.11 
 
 		 433 aa  590  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  66.43 
 
 		 433 aa  590  1e-167  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  62.65 
 
 		 439 aa  572  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  62.88 
 
 		 432 aa  568  1e-161  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  61.72 
 
 		 433 aa  570  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  62.88 
 
 		 432 aa  568  1e-161  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  58.74 
 
 		 434 aa  565  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  62.24 
 
 		 433 aa  566  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  61.31 
 
 		 433 aa  565  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  63.72 
 
 		 432 aa  567  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  61.48 
 
 		 433 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  62.65 
 
 		 432 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  61.25 
 
 		 434 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  61.48 
 
 		 432 aa  557  1e-157  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  61.07 
 
 		 436 aa  557  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  62.18 
 
 		 441 aa  555  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  60.79 
 
 		 433 aa  556  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  61.43 
 
 		 432 aa  553  1e-156  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  58 
 
 		 446 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  60.23 
 
 		 435 aa  545  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  58.84 
 
 		 433 aa  544  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  59.16 
 
 		 437 aa  541  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  61.2 
 
 		 433 aa  542  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  57.44 
 
 		 444 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  56.74 
 
 		 444 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  57.44 
 
 		 444 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  58.51 
 
 		 439 aa  535  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  59.02 
 
 		 439 aa  535  1e-151  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  59.07 
 
 		 436 aa  537  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  58.43 
 
 		 432 aa  535  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  57.44 
 
 		 433 aa  534  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  57.21 
 
 		 433 aa  532  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  58.51 
 
 		 439 aa  532  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  57.04 
 
 		 432 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  57.44 
 
 		 434 aa  527  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  58 
 
 		 431 aa  527  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  57.31 
 
 		 430 aa  523  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  58.73 
 
 		 438 aa  518  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  59.72 
 
 		 446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  59.07 
 
 		 433 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  58.02 
 
 		 444 aa  513  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  58.29 
 
 		 445 aa  510  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  55.09 
 
 		 433 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  57.82 
 
 		 441 aa  502  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  54.86 
 
 		 433 aa  504  1e-141  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  57.35 
 
 		 423 aa  503  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  58.29 
 
 		 441 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  54.63 
 
 		 433 aa  503  1e-141  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  57.58 
 
 		 441 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  54.17 
 
 		 433 aa  501  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  54.65 
 
 		 433 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  54.88 
 
 		 436 aa  488  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  54.06 
 
 		 432 aa  490  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  55.66 
 
 		 432 aa  484  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  55.97 
 
 		 431 aa  486  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  53.26 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  53.44 
 
 		 442 aa  485  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  52.21 
 
 		 436 aa  487  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  53.72 
 
 		 448 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  54.72 
 
 		 436 aa  483  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  55.81 
 
 		 434 aa  483  1e-135  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3634  phenylacetate-CoA ligase  53.15 
 
 		 444 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  52.93 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  52.07 
 
 		 437 aa  478  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  52.1 
 
 		 444 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  54.29 
 
 		 443 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  53.12 
 
 		 436 aa  478  1e-134  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  52.08 
 
 		 433 aa  476  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  53.16 
 
 		 445 aa  474  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  53.63 
 
 		 434 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  53.4 
 
 		 432 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0440  phenylacetate-CoA ligase  52.72 
 
 		 436 aa  477  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  52.31 
 
 		 435 aa  477  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  54.33 
 
 		 439 aa  476  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  53.76 
 
 		 433 aa  475  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  52.1 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  52.46 
 
 		 434 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  52.69 
 
 		 434 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  51.74 
 
 		 434 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  51.86 
 
 		 439 aa  470  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  52.09 
 
 		 434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  52.67 
 
 		 429 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  52 
 
 		 449 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  51.52 
 
 		 439 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>