More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2051 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  100 
 
 		 433 aa  883    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  82.68 
 
 		 433 aa  750    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0379  phenylacetate--CoA ligase  62.65 
 
 		 432 aa  576  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  60.32 
 
 		 694 aa  556  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  59.95 
 
 		 447 aa  548  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2452  phenylacetate--CoA ligase  59.33 
 
 		 432 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1721  Phenylacetate--CoA ligase  57.01 
 
 		 431 aa  488  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  57.55 
 
 		 433 aa  485  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  56.06 
 
 		 429 aa  487  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  54 
 
 		 427 aa  429  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  51.59 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2338  Phenylacetate--CoA ligase  50.96 
 
 		 426 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  50.37 
 
 		 414 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  51.57 
 
 		 413 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  50.37 
 
 		 414 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  51.97 
 
 		 415 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  49.51 
 
 		 414 aa  414  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  48.64 
 
 		 415 aa  411  1e-113  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  48.67 
 
 		 438 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  47.97 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  50.63 
 
 		 412 aa  379  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  48.32 
 
 		 412 aa  381  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  48.26 
 
 		 413 aa  375  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  42.18 
 
 		 432 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  42.28 
 
 		 433 aa  335  7e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  41.65 
 
 		 433 aa  328  8e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  40.92 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  42.08 
 
 		 435 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  42.28 
 
 		 444 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  41.61 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  42.69 
 
 		 435 aa  323  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  42.65 
 
 		 444 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  41.03 
 
 		 434 aa  322  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  42.22 
 
 		 432 aa  322  7e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  40.42 
 
 		 436 aa  321  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  40.33 
 
 		 432 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  41.49 
 
 		 434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  40.33 
 
 		 432 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  42.15 
 
 		 432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  42.42 
 
 		 446 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  40.51 
 
 		 430 aa  319  7e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  42.19 
 
 		 436 aa  318  7.999999999999999e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  40.56 
 
 		 432 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  40.94 
 
 		 432 aa  318  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  41.71 
 
 		 435 aa  318  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  41.57 
 
 		 444 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  41.61 
 
 		 438 aa  317  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  41.4 
 
 		 434 aa  317  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  40.33 
 
 		 432 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  40.33 
 
 		 432 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  41.84 
 
 		 434 aa  317  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  40.09 
 
 		 432 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  38.86 
 
 		 432 aa  316  6e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  41.75 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0440  phenylacetate-CoA ligase  40.79 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  40.74 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  39.11 
 
 		 434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  38.86 
 
 		 432 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  39.86 
 
 		 432 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  38.63 
 
 		 432 aa  312  1e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  39.24 
 
 		 435 aa  310  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  41.12 
 
 		 434 aa  311  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  41.94 
 
 		 434 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  40.19 
 
 		 434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  39.64 
 
 		 434 aa  310  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  40.79 
 
 		 434 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  41.75 
 
 		 434 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  39.53 
 
 		 434 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1509  phenylacetate-CoA ligase  40.65 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.047551  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  40.9 
 
 		 431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  41.23 
 
 		 435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  40.88 
 
 		 436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  41.13 
 
 		 434 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  41.13 
 
 		 435 aa  306  6e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  37.91 
 
 		 432 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  38.8 
 
 		 433 aa  305  9.000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  40.76 
 
 		 433 aa  305  9.000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  38.21 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  39.81 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  39.44 
 
 		 437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  38.46 
 
 		 431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  39.44 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  39.44 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  39.21 
 
 		 437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  39.52 
 
 		 428 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  40.47 
 
 		 432 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  40.66 
 
 		 433 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  40.65 
 
 		 440 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  38.89 
 
 		 435 aa  302  7.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  40 
 
 		 432 aa  301  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  40.24 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  39.02 
 
 		 434 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  40.23 
 
 		 443 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  40.65 
 
 		 440 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  40.65 
 
 		 440 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0374  phenylacetate-CoA ligase  39.03 
 
 		 441 aa  300  3e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000302001  hitchhiker  0.00000497277 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3568  phenylacetate-CoA ligase  40.23 
 
 		 432 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172482  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26570  phenylacetate-CoA ligase  40.98 
 
 		 448 aa  300  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.123505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  38.84 
 
 		 439 aa  300  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  38.77 
 
 		 432 aa  300  4e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>