More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0815 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 439 aa  899    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  69.75 
 
 		 433 aa  630  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  68.29 
 
 		 432 aa  620  1e-176  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  65.66 
 
 		 433 aa  611  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  65.97 
 
 		 433 aa  601  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  65.05 
 
 		 434 aa  598  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  65.05 
 
 		 434 aa  597  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  65.28 
 
 		 435 aa  593  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  62.9 
 
 		 434 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  64.2 
 
 		 435 aa  589  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  63.28 
 
 		 436 aa  589  1e-167  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  65.13 
 
 		 433 aa  589  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  62.73 
 
 		 432 aa  591  1e-167  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  62.73 
 
 		 432 aa  588  1e-167  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  65.58 
 
 		 433 aa  589  1e-167  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  62.27 
 
 		 432 aa  585  1e-166  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  64.5 
 
 		 434 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  61.66 
 
 		 434 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  64.35 
 
 		 441 aa  578  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  62.96 
 
 		 433 aa  580  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  63.89 
 
 		 435 aa  580  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  63.19 
 
 		 433 aa  580  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  60.88 
 
 		 432 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  63.11 
 
 		 434 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  62.65 
 
 		 433 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  62.65 
 
 		 433 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  61.81 
 
 		 433 aa  571  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  62.5 
 
 		 433 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  61.2 
 
 		 435 aa  569  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  63.34 
 
 		 432 aa  570  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  65.35 
 
 		 432 aa  568  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  63.74 
 
 		 433 aa  570  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  60.51 
 
 		 433 aa  566  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  61.45 
 
 		 435 aa  560  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  59.58 
 
 		 433 aa  558  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  59.58 
 
 		 433 aa  557  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  60 
 
 		 434 aa  557  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  60 
 
 		 436 aa  549  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  59.16 
 
 		 434 aa  548  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  59.82 
 
 		 435 aa  543  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  60.05 
 
 		 433 aa  534  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  58.24 
 
 		 432 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  57.41 
 
 		 439 aa  525  1e-148  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  57.41 
 
 		 439 aa  524  1e-147  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  56.98 
 
 		 432 aa  524  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  57.18 
 
 		 439 aa  521  1e-146  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  56.48 
 
 		 431 aa  515  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  58.31 
 
 		 438 aa  512  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  56.48 
 
 		 433 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  55.79 
 
 		 433 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  55.35 
 
 		 430 aa  502  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  57.21 
 
 		 423 aa  501  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  54.97 
 
 		 433 aa  501  1e-140  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  53.47 
 
 		 446 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  53.7 
 
 		 433 aa  497  1e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  54.99 
 
 		 443 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  54.42 
 
 		 444 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  55.45 
 
 		 444 aa  488  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  54.04 
 
 		 444 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  55.68 
 
 		 433 aa  490  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  55.79 
 
 		 441 aa  485  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  56.03 
 
 		 441 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  56.03 
 
 		 446 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  55.32 
 
 		 441 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  52.95 
 
 		 444 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  54.4 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  55.56 
 
 		 434 aa  481  1e-134  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  53.94 
 
 		 432 aa  479  1e-134  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  54.73 
 
 		 437 aa  476  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  54.87 
 
 		 445 aa  476  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  53.47 
 
 		 433 aa  478  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  51.51 
 
 		 436 aa  475  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  54.02 
 
 		 434 aa  473  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  53.3 
 
 		 441 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  52.68 
 
 		 437 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  51.97 
 
 		 435 aa  471  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  54.65 
 
 		 433 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  53.05 
 
 		 441 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  53.36 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  52.58 
 
 		 441 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  52.58 
 
 		 441 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  51.74 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  51.39 
 
 		 429 aa  458  1e-127  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  52.83 
 
 		 431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  51.77 
 
 		 423 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2486  phenylacetate-CoA ligase  52.59 
 
 		 450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  54.35 
 
 		 436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  52.55 
 
 		 428 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  53.27 
 
 		 439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  53.07 
 
 		 448 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  50 
 
 		 433 aa  451  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  51.62 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  50.7 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  51.38 
 
 		 433 aa  451  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  52.03 
 
 		 444 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  51.36 
 
 		 442 aa  450  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  51.39 
 
 		 433 aa  451  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  50.47 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  55.14 
 
 		 438 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  50 
 
 		 436 aa  445  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>