More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3083 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 423 aa  875    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  69.5 
 
 		 432 aa  622  1e-177  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  69.27 
 
 		 432 aa  622  1e-177  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  69.74 
 
 		 432 aa  620  1e-176  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  66.19 
 
 		 432 aa  608  1e-173  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  64.54 
 
 		 433 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  63.12 
 
 		 433 aa  579  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  64.39 
 
 		 433 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  64.15 
 
 		 436 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  63.83 
 
 		 433 aa  570  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  63.27 
 
 		 433 aa  565  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  63.36 
 
 		 433 aa  566  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  63.27 
 
 		 432 aa  558  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  60.28 
 
 		 432 aa  532  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  58.63 
 
 		 441 aa  528  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  58.63 
 
 		 434 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  60.59 
 
 		 432 aa  523  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  58.96 
 
 		 435 aa  518  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  58.16 
 
 		 433 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  59.24 
 
 		 435 aa  514  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  58.39 
 
 		 435 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  57.55 
 
 		 433 aa  511  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  58.77 
 
 		 434 aa  510  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  58.53 
 
 		 434 aa  511  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  57.78 
 
 		 434 aa  511  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  56.37 
 
 		 433 aa  511  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  56.26 
 
 		 434 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  55.08 
 
 		 434 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  57.35 
 
 		 433 aa  503  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  57.21 
 
 		 439 aa  501  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  55.56 
 
 		 433 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  53.66 
 
 		 434 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  54.72 
 
 		 435 aa  491  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  55.56 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  53.79 
 
 		 435 aa  488  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  51.3 
 
 		 434 aa  488  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  52.48 
 
 		 431 aa  482  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  52.37 
 
 		 433 aa  482  1e-135  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  54.42 
 
 		 430 aa  481  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  55.82 
 
 		 433 aa  480  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  51.89 
 
 		 433 aa  476  1e-133  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  51.54 
 
 		 433 aa  473  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  51.18 
 
 		 433 aa  473  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  53.69 
 
 		 433 aa  472  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  53.79 
 
 		 438 aa  474  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  51.3 
 
 		 433 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  50.71 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  52.73 
 
 		 432 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  51.06 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  51.78 
 
 		 432 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  50.59 
 
 		 435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  51.3 
 
 		 436 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  52.22 
 
 		 437 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  52.96 
 
 		 436 aa  459  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  53.79 
 
 		 441 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  50.82 
 
 		 439 aa  458  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  51.89 
 
 		 434 aa  457  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  53.79 
 
 		 441 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  51.29 
 
 		 439 aa  458  1e-127  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  51.06 
 
 		 439 aa  457  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  54.03 
 
 		 441 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  50.95 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  53.96 
 
 		 444 aa  453  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  49.76 
 
 		 434 aa  451  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  52.13 
 
 		 446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  52.13 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  51.87 
 
 		 443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  50 
 
 		 433 aa  443  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  52.12 
 
 		 434 aa  444  1e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  50.12 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  51.92 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  51.66 
 
 		 445 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  52.36 
 
 		 433 aa  437  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  49.17 
 
 		 435 aa  435  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  47.64 
 
 		 446 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  48.82 
 
 		 444 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  52.61 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  48.35 
 
 		 444 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  51.2 
 
 		 429 aa  434  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  49.06 
 
 		 444 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  52.25 
 
 		 433 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  52.24 
 
 		 437 aa  428  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  49.76 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  50 
 
 		 423 aa  426  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  52.24 
 
 		 437 aa  428  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  49.88 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  52.24 
 
 		 437 aa  428  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  50 
 
 		 441 aa  425  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  52.24 
 
 		 437 aa  428  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  50 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  49.14 
 
 		 428 aa  425  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  50.47 
 
 		 433 aa  424  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  50 
 
 		 441 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  50.82 
 
 		 433 aa  418  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  48.34 
 
 		 437 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  49.77 
 
 		 449 aa  420  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  50.24 
 
 		 436 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  48.82 
 
 		 433 aa  420  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  50 
 
 		 434 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  51.07 
 
 		 431 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>