More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0075 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  69.68 
 
 		 432 aa  640    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  82.37 
 
 		 432 aa  759    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 433 aa  895    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  69.91 
 
 		 432 aa  644    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  70.14 
 
 		 432 aa  645    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  70.14 
 
 		 432 aa  644    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  88.22 
 
 		 433 aa  808    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  87.04 
 
 		 433 aa  797    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  68.22 
 
 		 433 aa  632  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  67.67 
 
 		 433 aa  626  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  66.82 
 
 		 436 aa  622  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  67.21 
 
 		 433 aa  620  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  64.12 
 
 		 432 aa  597  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  62.5 
 
 		 434 aa  591  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  64.2 
 
 		 433 aa  587  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  62.09 
 
 		 434 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  61.43 
 
 		 433 aa  578  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  62.96 
 
 		 439 aa  580  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  64.58 
 
 		 441 aa  578  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  62.62 
 
 		 435 aa  574  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  62.65 
 
 		 435 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  64.39 
 
 		 423 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  61.06 
 
 		 435 aa  570  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  61.72 
 
 		 433 aa  570  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  63.19 
 
 		 432 aa  570  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  61.4 
 
 		 435 aa  568  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  60.88 
 
 		 433 aa  567  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  61.57 
 
 		 433 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  61.34 
 
 		 434 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  61.34 
 
 		 434 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  60.56 
 
 		 435 aa  561  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  59.95 
 
 		 434 aa  558  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  59.95 
 
 		 434 aa  558  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  59.03 
 
 		 433 aa  548  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  58 
 
 		 433 aa  542  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  58.47 
 
 		 434 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  57.18 
 
 		 434 aa  536  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  58.47 
 
 		 433 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  58.47 
 
 		 433 aa  536  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  59.08 
 
 		 436 aa  533  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  56.61 
 
 		 432 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  60.09 
 
 		 433 aa  525  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  55.35 
 
 		 432 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  57.11 
 
 		 435 aa  524  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  54.4 
 
 		 431 aa  520  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  54.72 
 
 		 438 aa  512  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  58.14 
 
 		 433 aa  513  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  57.31 
 
 		 446 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  54.15 
 
 		 439 aa  501  1e-141  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  53.95 
 
 		 430 aa  502  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  54.84 
 
 		 439 aa  502  1e-141  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  58.61 
 
 		 444 aa  502  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  55.43 
 
 		 433 aa  503  1e-141  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  54.97 
 
 		 433 aa  499  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  54.15 
 
 		 439 aa  501  1e-140  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  54.06 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  55.92 
 
 		 445 aa  494  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  53.92 
 
 		 433 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  53.36 
 
 		 433 aa  489  1e-137  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  55.3 
 
 		 437 aa  491  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  55.32 
 
 		 441 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  55.56 
 
 		 441 aa  485  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  52.53 
 
 		 436 aa  483  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  55.08 
 
 		 441 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  51.28 
 
 		 434 aa  482  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  52.09 
 
 		 433 aa  481  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  53.6 
 
 		 434 aa  483  1e-135  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  53.6 
 
 		 432 aa  483  1e-135  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  54.76 
 
 		 432 aa  479  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  54.46 
 
 		 434 aa  474  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  52.11 
 
 		 444 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  52.11 
 
 		 444 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  51.75 
 
 		 433 aa  473  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  50.46 
 
 		 446 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  54.59 
 
 		 434 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  53.77 
 
 		 431 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  53.7 
 
 		 443 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  54.82 
 
 		 434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  54.69 
 
 		 431 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  54.46 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  53.07 
 
 		 437 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  53.94 
 
 		 428 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  53.47 
 
 		 449 aa  466  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  51.86 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  52.56 
 
 		 429 aa  464  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  54.12 
 
 		 445 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  53.88 
 
 		 432 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  54.12 
 
 		 443 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  50.69 
 
 		 435 aa  462  1e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  53.88 
 
 		 432 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  53.88 
 
 		 432 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  51.17 
 
 		 444 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  53.88 
 
 		 439 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  53.88 
 
 		 432 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  54.12 
 
 		 432 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  53.88 
 
 		 432 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  52.39 
 
 		 442 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3117  phenylacetate-CoA ligase  54.12 
 
 		 434 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0603128  normal  0.0548798 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  53.54 
 
 		 434 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  53.05 
 
 		 444 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>