More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0169 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  98.61 
 
 		 432 aa  882    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  71.03 
 
 		 433 aa  653    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  71.16 
 
 		 433 aa  669    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  69.77 
 
 		 433 aa  657    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  97.69 
 
 		 432 aa  875    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  86.57 
 
 		 432 aa  802    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  69.91 
 
 		 433 aa  644    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  70.14 
 
 		 433 aa  645    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  68.84 
 
 		 436 aa  647    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 432 aa  895    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  69.44 
 
 		 433 aa  636    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  68.91 
 
 		 432 aa  633  1e-180  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  69.5 
 
 		 423 aa  622  1e-177  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  66.44 
 
 		 432 aa  615  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  65.97 
 
 		 441 aa  606  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  63.19 
 
 		 434 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  62.73 
 
 		 439 aa  591  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  64.27 
 
 		 432 aa  591  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  63.28 
 
 		 433 aa  588  1e-167  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  60.7 
 
 		 434 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  62.36 
 
 		 433 aa  581  1.0000000000000001e-165  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  61.34 
 
 		 433 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  61.72 
 
 		 435 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  61.92 
 
 		 435 aa  571  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  62.88 
 
 		 433 aa  568  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  61.4 
 
 		 435 aa  569  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  59.16 
 
 		 434 aa  567  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  61.34 
 
 		 434 aa  566  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  60.42 
 
 		 434 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  60.56 
 
 		 434 aa  559  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  60.32 
 
 		 434 aa  558  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  58.24 
 
 		 433 aa  557  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  59.72 
 
 		 433 aa  553  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  59.35 
 
 		 435 aa  553  1e-156  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  59.49 
 
 		 434 aa  551  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  59.95 
 
 		 433 aa  549  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  57.77 
 
 		 433 aa  549  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  57.77 
 
 		 433 aa  549  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  61.63 
 
 		 433 aa  545  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  57.34 
 
 		 435 aa  542  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  57.77 
 
 		 436 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  56.94 
 
 		 431 aa  538  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  58.7 
 
 		 435 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  57.04 
 
 		 433 aa  536  1e-151  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  56.81 
 
 		 433 aa  534  1e-150  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  56.58 
 
 		 433 aa  533  1e-150  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  58.7 
 
 		 433 aa  534  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  56.38 
 
 		 433 aa  528  1e-149  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  56.74 
 
 		 432 aa  528  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  56.28 
 
 		 432 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  56.05 
 
 		 430 aa  524  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  55.76 
 
 		 439 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  58.37 
 
 		 432 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  55.76 
 
 		 439 aa  514  1e-144  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  55.74 
 
 		 439 aa  511  1e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  56.37 
 
 		 438 aa  508  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  53.24 
 
 		 446 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  54.86 
 
 		 444 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  53.72 
 
 		 444 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  54.38 
 
 		 437 aa  500  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  54.65 
 
 		 444 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  54.11 
 
 		 443 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  55.74 
 
 		 431 aa  490  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  53.6 
 
 		 434 aa  491  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  52.67 
 
 		 434 aa  488  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  53.99 
 
 		 446 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  52.08 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  53.6 
 
 		 432 aa  485  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  55.98 
 
 		 444 aa  482  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  55.99 
 
 		 431 aa  483  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  53.54 
 
 		 437 aa  483  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  57.44 
 
 		 438 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  53.76 
 
 		 445 aa  479  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  55.37 
 
 		 439 aa  478  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  52.39 
 
 		 441 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  54.21 
 
 		 436 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  51.71 
 
 		 441 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  55.14 
 
 		 448 aa  475  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  55.24 
 
 		 433 aa  478  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  51.94 
 
 		 441 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  52.78 
 
 		 436 aa  476  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  53.36 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  52.71 
 
 		 441 aa  471  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  54.23 
 
 		 437 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  53.15 
 
 		 434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  54 
 
 		 437 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  52.59 
 
 		 441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  53.27 
 
 		 434 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  52.59 
 
 		 441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  54 
 
 		 437 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  53.27 
 
 		 434 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  52.21 
 
 		 433 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  50.69 
 
 		 435 aa  467  9.999999999999999e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  54 
 
 		 437 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  52.36 
 
 		 441 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  53.04 
 
 		 432 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  51.86 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  53.04 
 
 		 432 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  52.69 
 
 		 434 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  53.22 
 
 		 444 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>