More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1507 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 
433 aa  881    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  70.6 
 
 
432 aa  619  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  64.04 
 
 
433 aa  611  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  63.81 
 
 
433 aa  610  1e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  63.34 
 
 
433 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  63.43 
 
 
432 aa  589  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  61.95 
 
 
433 aa  587  1e-166  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  63.17 
 
 
431 aa  580  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  62.04 
 
 
432 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  64.57 
 
 
433 aa  566  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  60 
 
 
430 aa  562  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  63.44 
 
 
438 aa  556  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  59.26 
 
 
437 aa  550  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  59.44 
 
 
433 aa  545  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  61.63 
 
 
432 aa  545  1e-154  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  61.4 
 
 
432 aa  546  1e-154  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  61.2 
 
 
433 aa  542  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  61.63 
 
 
432 aa  542  1e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  59.44 
 
 
435 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  60.56 
 
 
432 aa  535  1e-151  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  60.56 
 
 
435 aa  534  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  58.7 
 
 
432 aa  531  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  60.79 
 
 
441 aa  532  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  58.28 
 
 
433 aa  528  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  59.45 
 
 
434 aa  530  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  59.44 
 
 
434 aa  529  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  59.44 
 
 
434 aa  528  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  58.97 
 
 
435 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  58.14 
 
 
434 aa  528  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  58.04 
 
 
433 aa  527  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  59.58 
 
 
433 aa  526  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  58.93 
 
 
434 aa  525  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  59.43 
 
 
433 aa  526  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  59.62 
 
 
433 aa  526  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  62.56 
 
 
432 aa  523  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  57.21 
 
 
436 aa  522  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  58.43 
 
 
433 aa  524  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  58.14 
 
 
434 aa  521  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  55.84 
 
 
434 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  59.39 
 
 
435 aa  521  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  59.62 
 
 
433 aa  518  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  58 
 
 
435 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  58.97 
 
 
433 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  58.43 
 
 
433 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  58.14 
 
 
433 aa  513  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  57.01 
 
 
436 aa  513  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  58.6 
 
 
433 aa  510  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  56.57 
 
 
434 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  58.8 
 
 
432 aa  509  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  58.7 
 
 
433 aa  511  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  55.01 
 
 
435 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  55.68 
 
 
439 aa  490  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  55.5 
 
 
433 aa  489  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  54.82 
 
 
439 aa  486  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  54.35 
 
 
439 aa  486  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  54.35 
 
 
439 aa  481  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  55.82 
 
 
423 aa  480  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  54.48 
 
 
446 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  54.59 
 
 
444 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  54.46 
 
 
445 aa  477  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  54.12 
 
 
444 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  51.05 
 
 
441 aa  464  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  53.5 
 
 
444 aa  466  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  53.65 
 
 
444 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  54.57 
 
 
446 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  54.42 
 
 
428 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1585  Phenylacetate--CoA ligase  51.06 
 
 
457 aa  462  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0730683 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  53.3 
 
 
432 aa  462  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  52.28 
 
 
443 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  53.16 
 
 
441 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  53.4 
 
 
441 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  53.4 
 
 
441 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  50.82 
 
 
441 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  50.82 
 
 
441 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  53.18 
 
 
433 aa  450  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  50.82 
 
 
441 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  51.75 
 
 
434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  50.58 
 
 
434 aa  443  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  49.65 
 
 
437 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  49.3 
 
 
436 aa  440  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  50.45 
 
 
439 aa  438  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  50.94 
 
 
436 aa  439  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  51.06 
 
 
431 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  50.94 
 
 
437 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1236  phenylacetate-CoA ligase  49.41 
 
 
436 aa  435  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  51.29 
 
 
444 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  50.12 
 
 
439 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  49.53 
 
 
434 aa  435  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  50.94 
 
 
437 aa  436  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  50.12 
 
 
448 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  50.7 
 
 
437 aa  434  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  50.94 
 
 
434 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  50.7 
 
 
437 aa  434  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  49.18 
 
 
433 aa  433  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  50.35 
 
 
436 aa  432  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  50.34 
 
 
442 aa  432  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  50.24 
 
 
434 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  50.12 
 
 
445 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  50.82 
 
 
434 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  49.18 
 
 
436 aa  433  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>