More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0036 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  100 
 
 
441 aa  876    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  81.41 
 
 
441 aa  717    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  99.55 
 
 
441 aa  872    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  99.32 
 
 
441 aa  871    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  55.35 
 
 
431 aa  481  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  51.52 
 
 
433 aa  473  1e-132  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  52.71 
 
 
432 aa  471  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  51.76 
 
 
432 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  51.89 
 
 
432 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  51.05 
 
 
433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  52.94 
 
 
432 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  52.59 
 
 
433 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  51.04 
 
 
433 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  55.71 
 
 
430 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  51.97 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  53.16 
 
 
435 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  53.97 
 
 
435 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  52.24 
 
 
432 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  54.35 
 
 
432 aa  465  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  50.58 
 
 
433 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  55.09 
 
 
433 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  50.93 
 
 
433 aa  463  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  51.51 
 
 
433 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  49.88 
 
 
432 aa  461  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  54.35 
 
 
433 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  53.05 
 
 
439 aa  464  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  51.72 
 
 
435 aa  462  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  54.23 
 
 
433 aa  461  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  51.03 
 
 
435 aa  464  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  53.41 
 
 
433 aa  463  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  52.24 
 
 
435 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  54.82 
 
 
435 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  54.82 
 
 
434 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  51.29 
 
 
434 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  50.59 
 
 
436 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  54.79 
 
 
432 aa  456  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  54.46 
 
 
438 aa  456  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  52.24 
 
 
436 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  52.47 
 
 
433 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  51.53 
 
 
433 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  50.82 
 
 
433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  52.59 
 
 
432 aa  448  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  50.59 
 
 
434 aa  448  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  49.41 
 
 
433 aa  448  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  50.82 
 
 
433 aa  450  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  51.53 
 
 
433 aa  451  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  50.82 
 
 
434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  52.72 
 
 
433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  51.41 
 
 
434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  53.98 
 
 
441 aa  448  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  50.35 
 
 
434 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  51.65 
 
 
433 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  52.82 
 
 
446 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  50.59 
 
 
434 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  52.58 
 
 
434 aa  444  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  51.29 
 
 
433 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  52.58 
 
 
444 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  53.16 
 
 
444 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  53.05 
 
 
444 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  49.88 
 
 
423 aa  426  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  52.46 
 
 
437 aa  427  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  47.45 
 
 
437 aa  428  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  49.19 
 
 
439 aa  425  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  49.19 
 
 
439 aa  424  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  51.6 
 
 
443 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  54.08 
 
 
449 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  51.85 
 
 
434 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  48.34 
 
 
428 aa  422  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  50.93 
 
 
434 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  50 
 
 
431 aa  421  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3634  phenylacetate-CoA ligase  51.86 
 
 
444 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  50.93 
 
 
432 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  48.5 
 
 
439 aa  420  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  52.37 
 
 
445 aa  415  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  51.05 
 
 
448 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  50.93 
 
 
432 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  50.47 
 
 
432 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  49.89 
 
 
433 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  50.69 
 
 
434 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2486  phenylacetate-CoA ligase  52.45 
 
 
450 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773414  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  50.47 
 
 
432 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0477  phenylacetate-CoA ligase  52.82 
 
 
427 aa  412  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1829  phenylacetate-CoA ligase  50.12 
 
 
444 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.914606  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  50.7 
 
 
432 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  51.61 
 
 
445 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  52.97 
 
 
442 aa  412  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1923  phenylacetate-CoA ligase  49.77 
 
 
443 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0702505  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  51.16 
 
 
434 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  53.19 
 
 
441 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  52.53 
 
 
438 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  50.47 
 
 
432 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2870  phenylacetate-CoA ligase  50.69 
 
 
442 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  50.47 
 
 
432 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  52.96 
 
 
441 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  48.97 
 
 
436 aa  408  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3577  phenylacetate-CoA ligase  50.23 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306139  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  54.14 
 
 
446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  52.25 
 
 
441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  48.97 
 
 
444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  51.38 
 
 
443 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>