More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1729 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  100 
 
 		 433 aa  902    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  84.76 
 
 		 433 aa  786    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  89.15 
 
 		 433 aa  790    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  85.22 
 
 		 433 aa  788    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  87.04 
 
 		 434 aa  800    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  85.85 
 
 		 436 aa  786    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  84.53 
 
 		 435 aa  780    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  62.82 
 
 		 433 aa  585  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  60.47 
 
 		 432 aa  568  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  59.12 
 
 		 433 aa  567  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  60.51 
 
 		 439 aa  566  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  59.44 
 
 		 432 aa  558  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  58.24 
 
 		 432 aa  557  1e-157  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  59.07 
 
 		 433 aa  556  1e-157  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  59.49 
 
 		 433 aa  556  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  58 
 
 		 432 aa  558  1e-157  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  57.87 
 
 		 433 aa  553  1e-156  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  57.77 
 
 		 432 aa  551  1e-156  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  58.6 
 
 		 433 aa  554  1e-156  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  60.88 
 
 		 433 aa  549  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  57.44 
 
 		 433 aa  545  1e-154  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  59.91 
 
 		 435 aa  545  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  57.31 
 
 		 432 aa  545  1e-154  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  59.35 
 
 		 435 aa  547  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  58.37 
 
 		 441 aa  546  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  57.27 
 
 		 436 aa  544  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  59.44 
 
 		 433 aa  545  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  60.09 
 
 		 435 aa  543  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  58.84 
 
 		 433 aa  544  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  56.84 
 
 		 431 aa  541  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  56.88 
 
 		 432 aa  544  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  58 
 
 		 433 aa  542  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  58.33 
 
 		 434 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  60.56 
 
 		 432 aa  538  9.999999999999999e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  58.37 
 
 		 433 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  59.21 
 
 		 434 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  58.56 
 
 		 433 aa  537  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  58.97 
 
 		 434 aa  535  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  57.54 
 
 		 434 aa  531  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  57.21 
 
 		 432 aa  529  1e-149  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  57.31 
 
 		 433 aa  530  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  56.41 
 
 		 430 aa  528  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  56.52 
 
 		 434 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  55.92 
 
 		 433 aa  527  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  60.93 
 
 		 428 aa  527  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  56.51 
 
 		 434 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  56.15 
 
 		 433 aa  526  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  57.78 
 
 		 438 aa  518  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  56.84 
 
 		 434 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  57.14 
 
 		 437 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  56.48 
 
 		 435 aa  511  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  55.12 
 
 		 435 aa  513  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  54.71 
 
 		 437 aa  508  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  54.99 
 
 		 433 aa  500  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  53.1 
 
 		 439 aa  494  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  54.06 
 
 		 446 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  55.12 
 
 		 444 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  52.87 
 
 		 439 aa  493  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  55.71 
 
 		 432 aa  491  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  54.88 
 
 		 444 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  51.95 
 
 		 439 aa  491  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  55.32 
 
 		 446 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  53.49 
 
 		 444 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  54.12 
 
 		 441 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  51.54 
 
 		 423 aa  473  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  54.12 
 
 		 441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  54.12 
 
 		 441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  52.42 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  51.65 
 
 		 441 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  51.5 
 
 		 443 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  52.09 
 
 		 437 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  53.52 
 
 		 434 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  50.93 
 
 		 441 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  54.59 
 
 		 434 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  53.54 
 
 		 433 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  51.51 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  52.61 
 
 		 445 aa  463  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  54.35 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  53.11 
 
 		 444 aa  460  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  51.89 
 
 		 434 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0440  phenylacetate-CoA ligase  52.14 
 
 		 436 aa  461  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  50.81 
 
 		 441 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  50.81 
 
 		 441 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  52.59 
 
 		 436 aa  461  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  49.89 
 
 		 442 aa  455  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  53.18 
 
 		 432 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  53.18 
 
 		 432 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  53.65 
 
 		 432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  52.71 
 
 		 434 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  53.65 
 
 		 432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  53.65 
 
 		 432 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  52 
 
 		 439 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  51.85 
 
 		 431 aa  448  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  48.5 
 
 		 434 aa  449  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  52.71 
 
 		 432 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0838  phenylacetate--CoA ligase  49.77 
 
 		 431 aa  450  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  51.75 
 
 		 431 aa  450  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  51.88 
 
 		 444 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  49.65 
 
 		 432 aa  450  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  50.7 
 
 		 429 aa  449  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>