More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0041 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 
446 aa  900    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  82.54 
 
 
441 aa  721    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  82.09 
 
 
441 aa  718    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  82.09 
 
 
441 aa  721    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  72.02 
 
 
444 aa  641    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  71.06 
 
 
445 aa  619  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  60.14 
 
 
435 aa  544  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  59.43 
 
 
435 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  59.57 
 
 
435 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  58.73 
 
 
434 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  58.39 
 
 
434 aa  538  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  59.72 
 
 
433 aa  535  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  58.39 
 
 
434 aa  536  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  61.85 
 
 
434 aa  528  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  61.41 
 
 
435 aa  528  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  60.05 
 
 
433 aa  525  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  59.2 
 
 
433 aa  525  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  57.45 
 
 
433 aa  526  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  58.71 
 
 
434 aa  522  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  58.49 
 
 
433 aa  521  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  58.82 
 
 
432 aa  524  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  58.63 
 
 
434 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  55.97 
 
 
433 aa  520  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  57.31 
 
 
433 aa  520  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  56.26 
 
 
433 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  56.26 
 
 
433 aa  508  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  55.21 
 
 
433 aa  504  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  53.99 
 
 
432 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  55.32 
 
 
432 aa  503  1e-141  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  59.41 
 
 
432 aa  502  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  56.97 
 
 
435 aa  501  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  55.34 
 
 
432 aa  503  1e-141  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  54.06 
 
 
439 aa  501  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  56.64 
 
 
432 aa  499  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  57.21 
 
 
433 aa  500  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  55.9 
 
 
433 aa  501  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  56.03 
 
 
439 aa  499  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  57.35 
 
 
434 aa  499  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  55.32 
 
 
433 aa  495  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  53.88 
 
 
439 aa  495  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  54.14 
 
 
432 aa  494  1e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  54.12 
 
 
439 aa  496  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  53.61 
 
 
436 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  57.18 
 
 
441 aa  489  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  55.89 
 
 
446 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  56.25 
 
 
444 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  53.97 
 
 
433 aa  485  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  54.61 
 
 
434 aa  487  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  53.74 
 
 
433 aa  484  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  53.79 
 
 
432 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  54.14 
 
 
431 aa  483  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  54.61 
 
 
436 aa  482  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  55.14 
 
 
444 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  54.61 
 
 
435 aa  484  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  54.57 
 
 
433 aa  478  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  54.63 
 
 
437 aa  475  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  55.19 
 
 
444 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  53.19 
 
 
433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  51.65 
 
 
434 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  55.34 
 
 
438 aa  466  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  49.65 
 
 
433 aa  463  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  49.07 
 
 
433 aa  462  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  52.13 
 
 
423 aa  464  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  49.88 
 
 
433 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  53.33 
 
 
430 aa  461  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  51.64 
 
 
432 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  53.54 
 
 
434 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  55.2 
 
 
439 aa  457  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  53.35 
 
 
444 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  53.81 
 
 
434 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  52.68 
 
 
443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  47.2 
 
 
433 aa  451  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  52.62 
 
 
434 aa  449  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  53.68 
 
 
434 aa  448  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  53.21 
 
 
433 aa  451  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0440  phenylacetate-CoA ligase  53.22 
 
 
436 aa  449  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  51.3 
 
 
432 aa  451  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  54.25 
 
 
436 aa  448  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  53.11 
 
 
439 aa  450  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  52.61 
 
 
434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1923  phenylacetate-CoA ligase  52.18 
 
 
443 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0702505  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  49.53 
 
 
434 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  51.67 
 
 
436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  54.97 
 
 
449 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2870  phenylacetate-CoA ligase  51.8 
 
 
442 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  52.59 
 
 
433 aa  442  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  52.16 
 
 
449 aa  441  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  51.54 
 
 
432 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  52.02 
 
 
432 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  49.53 
 
 
433 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  52.02 
 
 
432 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  52.26 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  52.26 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  48.48 
 
 
437 aa  438  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  53.44 
 
 
443 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  50.71 
 
 
433 aa  437  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  51.54 
 
 
432 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  53.85 
 
 
442 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  53.92 
 
 
445 aa  435  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  49.29 
 
 
431 aa  432  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>