More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4074 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  100 
 
 		 437 aa  897    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  55.66 
 
 		 436 aa  512  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  54.71 
 
 		 433 aa  508  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  54.48 
 
 		 433 aa  501  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  54.48 
 
 		 433 aa  500  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  54.5 
 
 		 435 aa  499  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  53.35 
 
 		 434 aa  488  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  55.63 
 
 		 433 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  50.58 
 
 		 433 aa  448  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  50.69 
 
 		 432 aa  448  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  49.54 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  49.41 
 
 		 438 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  50.35 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  49.07 
 
 		 441 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  47.59 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  46.88 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  48.05 
 
 		 433 aa  435  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  48.38 
 
 		 435 aa  431  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  46.87 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  48.51 
 
 		 433 aa  428  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  49.42 
 
 		 433 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  47.36 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  46.9 
 
 		 432 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  52.31 
 
 		 428 aa  425  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  48.16 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  48.05 
 
 		 434 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  46.9 
 
 		 432 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  47.8 
 
 		 434 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  48.26 
 
 		 434 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  47.22 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0838  phenylacetate--CoA ligase  48.04 
 
 		 431 aa  423  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  47.47 
 
 		 433 aa  421  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  48.85 
 
 		 432 aa  423  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  48.05 
 
 		 439 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  47.13 
 
 		 434 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  48.04 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  47.83 
 
 		 433 aa  419  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  47.02 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  47.11 
 
 		 433 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  46.87 
 
 		 434 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  47.26 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  47.37 
 
 		 433 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  46.3 
 
 		 433 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  45.39 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  46.42 
 
 		 433 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  45.71 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  47.92 
 
 		 434 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  46.99 
 
 		 432 aa  409  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  44.44 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  45.14 
 
 		 435 aa  411  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  49.2 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  47.93 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  44.95 
 
 		 436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  46.35 
 
 		 423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  44.93 
 
 		 433 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  47.1 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  45.6 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  44.11 
 
 		 433 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  44.71 
 
 		 431 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  46.03 
 
 		 442 aa  393  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  47 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  45.31 
 
 		 448 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  43.02 
 
 		 439 aa  386  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  43.48 
 
 		 439 aa  385  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  43.25 
 
 		 439 aa  385  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  45.31 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  44.11 
 
 		 446 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2630  phenylacetate-CoA ligase  45.41 
 
 		 439 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460145  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  46.96 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  44.01 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  44.47 
 
 		 439 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2870  phenylacetate-CoA ligase  44.94 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  45.18 
 
 		 444 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  43.94 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  44.78 
 
 		 444 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  45.07 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  44.63 
 
 		 437 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  44.86 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  43.79 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2617  phenylacetate-CoA ligase  44.24 
 
 		 439 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.174416 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  44.86 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1509  phenylacetate-CoA ligase  45.19 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.047551  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2480  phenylacetate-CoA ligase  44.24 
 
 		 439 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  44.6 
 
 		 445 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  44.21 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  44.08 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  43.09 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  44.19 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  44.86 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  45.41 
 
 		 434 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  45.6 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  44.84 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  44.84 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  45.31 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  43.76 
 
 		 433 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  43.9 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  43.85 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0986  phenylacetate-CoA ligase  45.15 
 
 		 435 aa  371  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  44.13 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  44.73 
 
 		 434 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>