More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_02550 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  76.27 
 
 		 413 aa  664    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  100 
 
 		 412 aa  850    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  65.05 
 
 		 412 aa  570  1e-161  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  64.63 
 
 		 413 aa  552  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  61.95 
 
 		 414 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  61.95 
 
 		 414 aa  537  1e-151  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  62.01 
 
 		 414 aa  536  1e-151  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  62.34 
 
 		 415 aa  522  1e-147  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  64.69 
 
 		 415 aa  523  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  59.32 
 
 		 435 aa  508  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  59.81 
 
 		 438 aa  497  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  59.95 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  59.95 
 
 		 428 aa  482  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  49.38 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0379  phenylacetate--CoA ligase  47.22 
 
 		 432 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  46.67 
 
 		 694 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  48.32 
 
 		 433 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  45.73 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2452  phenylacetate--CoA ligase  48.55 
 
 		 432 aa  361  1e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  46.19 
 
 		 433 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  46.97 
 
 		 429 aa  358  9e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  44.44 
 
 		 432 aa  345  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1721  Phenylacetate--CoA ligase  44.81 
 
 		 431 aa  341  2e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  43.06 
 
 		 432 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  42.58 
 
 		 432 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  42.58 
 
 		 432 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  42.58 
 
 		 432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  42.58 
 
 		 432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  43.06 
 
 		 432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  43.06 
 
 		 432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  44.21 
 
 		 433 aa  335  7e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  42.51 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  41.16 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  44.33 
 
 		 434 aa  333  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  41.89 
 
 		 434 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  42.37 
 
 		 434 aa  332  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  41.79 
 
 		 433 aa  332  7.000000000000001e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  42.13 
 
 		 434 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  41.57 
 
 		 439 aa  331  1e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  41.69 
 
 		 434 aa  332  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  42.86 
 
 		 434 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  43.34 
 
 		 432 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  40.71 
 
 		 434 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  41.75 
 
 		 431 aa  330  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  41.39 
 
 		 438 aa  330  3e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  43.61 
 
 		 433 aa  330  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  40.48 
 
 		 439 aa  330  4e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2338  Phenylacetate--CoA ligase  45.99 
 
 		 426 aa  330  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  42.86 
 
 		 436 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  40.91 
 
 		 439 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  41.16 
 
 		 432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  42.45 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  42.96 
 
 		 435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  42.68 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  41.67 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  41.45 
 
 		 434 aa  327  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  38.9 
 
 		 434 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  44.81 
 
 		 433 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  41.16 
 
 		 432 aa  326  5e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  40.68 
 
 		 433 aa  326  5e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  40.91 
 
 		 429 aa  326  6e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  41.97 
 
 		 433 aa  325  6e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  42.27 
 
 		 435 aa  325  7e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  42.68 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  42.27 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  43.1 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3550  phenylacetate-CoA ligase  42.86 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489447  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3577  phenylacetate-CoA ligase  42.86 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306139  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  44.07 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3568  phenylacetate-CoA ligase  42.86 
 
 		 432 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172482  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  42.37 
 
 		 432 aa  323  4e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  41.85 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  41.16 
 
 		 432 aa  323  4e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  42.07 
 
 		 435 aa  323  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  40.92 
 
 		 432 aa  323  4e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  42.58 
 
 		 434 aa  322  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  43.22 
 
 		 432 aa  322  6e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  42.55 
 
 		 436 aa  321  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  40.91 
 
 		 435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  40.67 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0539  phenylacetate-coenzyme A ligase  42.62 
 
 		 432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0321632  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0935  phenylacetate-coenzyme A ligase  42.62 
 
 		 432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  39.95 
 
 		 431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  40.77 
 
 		 434 aa  320  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0638  phenylacetate-CoA ligase  42.62 
 
 		 432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1905  phenylacetate-coenzyme A ligase  42.62 
 
 		 432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511484  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2630  phenylacetate-CoA ligase  40.33 
 
 		 439 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460145  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  40.68 
 
 		 433 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  40.05 
 
 		 436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  41.01 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  42.93 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2480  phenylacetate-CoA ligase  40.67 
 
 		 439 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  42.34 
 
 		 443 aa  319  5e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  42.36 
 
 		 436 aa  319  6e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  40.82 
 
 		 434 aa  318  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  41.79 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  40.1 
 
 		 436 aa  318  1e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  41.62 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  41.69 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  41.69 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>