More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2452 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2452  phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 432 aa  879    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  75.58 
 
 		 433 aa  663    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1721  Phenylacetate--CoA ligase  78.94 
 
 		 431 aa  698    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  65.81 
 
 		 429 aa  585  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2338  Phenylacetate--CoA ligase  64.94 
 
 		 426 aa  557  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0379  phenylacetate--CoA ligase  62.53 
 
 		 432 aa  552  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  58.92 
 
 		 694 aa  518  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  59.21 
 
 		 433 aa  504  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  59.33 
 
 		 433 aa  496  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  57.41 
 
 		 447 aa  497  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  53.08 
 
 		 435 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  51.83 
 
 		 438 aa  420  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  51.62 
 
 		 414 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  51.87 
 
 		 414 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  51.87 
 
 		 415 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  50.37 
 
 		 414 aa  409  1e-113  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  50.58 
 
 		 427 aa  410  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  49.88 
 
 		 415 aa  404  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  48.23 
 
 		 428 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  47.94 
 
 		 413 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  47.75 
 
 		 446 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  47.32 
 
 		 412 aa  368  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  48.55 
 
 		 412 aa  361  1e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  47.5 
 
 		 413 aa  360  4e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  45.5 
 
 		 434 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  44.47 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  43.03 
 
 		 433 aa  354  1e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  45.58 
 
 		 444 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  45.48 
 
 		 444 aa  348  7e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  41.37 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  41.47 
 
 		 433 aa  346  5e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  43.43 
 
 		 429 aa  345  6e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  44.68 
 
 		 432 aa  344  1e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  44.15 
 
 		 432 aa  344  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  44.79 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  43.87 
 
 		 432 aa  340  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  44.08 
 
 		 444 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  41.37 
 
 		 433 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  43.94 
 
 		 439 aa  338  8e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  42.86 
 
 		 433 aa  338  9e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  41.45 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  41.69 
 
 		 433 aa  335  1e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  41.51 
 
 		 433 aa  335  1e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  42.99 
 
 		 434 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  43.63 
 
 		 433 aa  335  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  43.33 
 
 		 428 aa  334  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  43.82 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  40.57 
 
 		 433 aa  334  2e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  42.24 
 
 		 432 aa  334  2e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1908  phenylacetate-CoA ligase  43.6 
 
 		 446 aa  333  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  44.42 
 
 		 437 aa  333  4e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  44.42 
 
 		 437 aa  333  4e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  41.88 
 
 		 432 aa  333  4e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  41.82 
 
 		 432 aa  333  4e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  41.61 
 
 		 436 aa  333  5e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  44.42 
 
 		 437 aa  332  6e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  41.65 
 
 		 432 aa  332  6e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  41.27 
 
 		 433 aa  332  8e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  43.9 
 
 		 439 aa  332  9e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  44.19 
 
 		 437 aa  331  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  45.61 
 
 		 438 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  44.09 
 
 		 432 aa  332  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  44.15 
 
 		 434 aa  330  2e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  43.36 
 
 		 432 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  43.12 
 
 		 434 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  42.17 
 
 		 431 aa  331  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  40.71 
 
 		 436 aa  330  3e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  42.42 
 
 		 437 aa  330  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  43.36 
 
 		 432 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  43.59 
 
 		 435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  43.12 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  40.98 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  43.62 
 
 		 441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  43.66 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  44.29 
 
 		 434 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  40.98 
 
 		 434 aa  327  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  41.43 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  43.12 
 
 		 432 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  43.12 
 
 		 432 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  43.36 
 
 		 432 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  40.71 
 
 		 436 aa  326  5e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  43.6 
 
 		 430 aa  325  7e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  42.99 
 
 		 433 aa  325  9e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  43.78 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  42.82 
 
 		 430 aa  325  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  43.26 
 
 		 438 aa  324  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  42.89 
 
 		 432 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  42.62 
 
 		 433 aa  323  3e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  42.02 
 
 		 433 aa  323  4e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  40.84 
 
 		 433 aa  323  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  42.62 
 
 		 435 aa  323  4e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  40.6 
 
 		 433 aa  323  5e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  42.79 
 
 		 436 aa  322  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  39.62 
 
 		 434 aa  322  8e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1029  Phenylacetate--CoA ligase  44.74 
 
 		 429 aa  321  9.999999999999999e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  42.38 
 
 		 434 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  42.32 
 
 		 433 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  43.06 
 
 		 444 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  38.95 
 
 		 423 aa  320  3e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2630  phenylacetate-CoA ligase  42.76 
 
 		 439 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460145  normal  0.0722332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>