More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2338 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2338  Phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 426 aa  869    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1721  Phenylacetate--CoA ligase  65.88 
 
 		 431 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2452  phenylacetate--CoA ligase  64.94 
 
 		 432 aa  557  1e-157  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  63.79 
 
 		 433 aa  537  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  59.48 
 
 		 429 aa  511  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0379  phenylacetate--CoA ligase  53.5 
 
 		 432 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  52.68 
 
 		 447 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  50.93 
 
 		 694 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  52.3 
 
 		 433 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  50.96 
 
 		 433 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  46.24 
 
 		 435 aa  387  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  45.97 
 
 		 438 aa  375  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  46.08 
 
 		 415 aa  373  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  47.93 
 
 		 428 aa  365  1e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  45.06 
 
 		 414 aa  365  1e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  46.02 
 
 		 413 aa  363  4e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  45.78 
 
 		 415 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  45.66 
 
 		 414 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  45.06 
 
 		 414 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  46.75 
 
 		 412 aa  360  2e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  46.72 
 
 		 427 aa  353  4e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  44 
 
 		 413 aa  342  1e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  45.99 
 
 		 412 aa  330  4e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  41.23 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  41.29 
 
 		 432 aa  318  7.999999999999999e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  41.19 
 
 		 432 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  41.53 
 
 		 432 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  40.38 
 
 		 432 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  40.38 
 
 		 432 aa  308  9e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  41.07 
 
 		 432 aa  306  4.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  40.14 
 
 		 432 aa  306  6e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  39.9 
 
 		 433 aa  305  9.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  38.08 
 
 		 434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  41.22 
 
 		 434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  40.71 
 
 		 434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  39.56 
 
 		 428 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  37.68 
 
 		 423 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  39.43 
 
 		 432 aa  303  5.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  39.15 
 
 		 429 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  39.17 
 
 		 433 aa  302  7.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  39.67 
 
 		 433 aa  300  2e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  38.72 
 
 		 433 aa  299  5e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  39.19 
 
 		 432 aa  299  5e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  37.44 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  38.95 
 
 		 433 aa  298  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  40 
 
 		 429 aa  297  3e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  43.33 
 
 		 427 aa  296  4e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26570  phenylacetate-CoA ligase  40.52 
 
 		 448 aa  295  7e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.123505 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  40.38 
 
 		 441 aa  295  9e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  40.93 
 
 		 432 aa  294  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  40.33 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  39.04 
 
 		 436 aa  294  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  38.39 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  39.95 
 
 		 430 aa  293  4e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  38.81 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  37.68 
 
 		 436 aa  293  5e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  39.43 
 
 		 434 aa  292  6e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  38.35 
 
 		 433 aa  293  6e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  38.92 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  38.59 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  38.26 
 
 		 430 aa  290  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  38.81 
 
 		 433 aa  290  4e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2189  phenylacetate-CoA ligase  41.22 
 
 		 434 aa  290  5.0000000000000004e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0357047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  36.21 
 
 		 434 aa  289  6e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  38.64 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  39.43 
 
 		 428 aa  288  1e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  40.75 
 
 		 439 aa  288  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  39.58 
 
 		 433 aa  287  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  39.07 
 
 		 435 aa  287  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2897  Phenylacetate--CoA ligase  40.84 
 
 		 428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  39.65 
 
 		 434 aa  286  4e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  40 
 
 		 432 aa  285  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  40.19 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  37.53 
 
 		 439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  38.94 
 
 		 434 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  38.68 
 
 		 431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  37.59 
 
 		 439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  36.73 
 
 		 423 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  40.24 
 
 		 435 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  39.72 
 
 		 440 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1029  Phenylacetate--CoA ligase  41.53 
 
 		 429 aa  283  5.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  39.57 
 
 		 434 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  39.21 
 
 		 444 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  37.3 
 
 		 439 aa  281  1e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  38.75 
 
 		 433 aa  282  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  39.76 
 
 		 438 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  39.24 
 
 		 440 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  39.24 
 
 		 440 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  37.06 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  39.11 
 
 		 435 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  37.62 
 
 		 432 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1908  phenylacetate-CoA ligase  39.24 
 
 		 446 aa  280  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  39.48 
 
 		 440 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  39.24 
 
 		 440 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  37.67 
 
 		 433 aa  279  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  39.34 
 
 		 434 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  39.8 
 
 		 433 aa  279  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  36.17 
 
 		 436 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  39.39 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  39.95 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>