More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0060 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  76.27 
 
 		 412 aa  664    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 413 aa  853    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  64.89 
 
 		 412 aa  563  1.0000000000000001e-159  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  60.1 
 
 		 413 aa  521  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  60.19 
 
 		 414 aa  523  1e-147  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  59.27 
 
 		 414 aa  523  1e-147  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  59.85 
 
 		 414 aa  524  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  60.66 
 
 		 415 aa  508  1e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  60.84 
 
 		 415 aa  508  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  58.64 
 
 		 435 aa  495  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  57.18 
 
 		 438 aa  474  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  56.76 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  56.96 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0379  phenylacetate--CoA ligase  49.37 
 
 		 432 aa  391  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  48.09 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  47.26 
 
 		 694 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  48.49 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  48.26 
 
 		 433 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2452  phenylacetate--CoA ligase  47.5 
 
 		 432 aa  360  4e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  43.95 
 
 		 433 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1721  Phenylacetate--CoA ligase  45.73 
 
 		 431 aa  352  5e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  44.94 
 
 		 429 aa  350  3e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  43.2 
 
 		 435 aa  342  7e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2338  Phenylacetate--CoA ligase  44 
 
 		 426 aa  342  9e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  43.67 
 
 		 432 aa  340  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  43.29 
 
 		 433 aa  339  5e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  44.33 
 
 		 432 aa  338  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  41.93 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  41.09 
 
 		 434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  44.84 
 
 		 435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  43.32 
 
 		 433 aa  335  7e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  43.72 
 
 		 434 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  43.89 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  45.27 
 
 		 433 aa  334  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  42.37 
 
 		 431 aa  333  3e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  42.48 
 
 		 434 aa  333  5e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  41.87 
 
 		 435 aa  330  4e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  41.29 
 
 		 434 aa  328  9e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  41.93 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  40.81 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  41.53 
 
 		 435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  41.67 
 
 		 438 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  41.05 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  40.38 
 
 		 432 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  42.24 
 
 		 437 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  40.57 
 
 		 434 aa  326  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  43.07 
 
 		 434 aa  325  6e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  41.53 
 
 		 435 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  41.36 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  40.81 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  42.82 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  38.9 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  42.07 
 
 		 433 aa  323  3e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  41.43 
 
 		 430 aa  323  5e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  40.24 
 
 		 436 aa  322  7e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  40.33 
 
 		 434 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  40.67 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  40.81 
 
 		 432 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  40.38 
 
 		 432 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  39.53 
 
 		 439 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  42.82 
 
 		 432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  41.77 
 
 		 445 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  39.76 
 
 		 439 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  40.81 
 
 		 432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  42.82 
 
 		 432 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  39.43 
 
 		 433 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  40.38 
 
 		 442 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  42.11 
 
 		 432 aa  320  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  41.96 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  41.79 
 
 		 434 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  41.9 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  43.22 
 
 		 433 aa  319  5e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  43.07 
 
 		 433 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  40.57 
 
 		 432 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  41.9 
 
 		 438 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  40.81 
 
 		 432 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  40.81 
 
 		 432 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  40.57 
 
 		 432 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  42.46 
 
 		 434 aa  318  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  39.76 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  40.33 
 
 		 432 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  41.53 
 
 		 432 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  40.19 
 
 		 434 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  41.57 
 
 		 436 aa  317  2e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  41.16 
 
 		 436 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  39.62 
 
 		 433 aa  316  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  41.01 
 
 		 434 aa  316  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  40.78 
 
 		 434 aa  316  6e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  42.82 
 
 		 433 aa  315  7e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  40.8 
 
 		 429 aa  315  7e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  42.17 
 
 		 433 aa  315  7e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  40.1 
 
 		 444 aa  315  7e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  42.32 
 
 		 432 aa  315  8e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  39.86 
 
 		 444 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  42.17 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  42.86 
 
 		 436 aa  315  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  39 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  40.81 
 
 		 429 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  41.56 
 
 		 432 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  40.24 
 
 		 434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>