More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0939 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  72.85 
 
 		 434 aa  681    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 432 aa  892    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  71.69 
 
 		 432 aa  669    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  68.29 
 
 		 432 aa  625  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  65.12 
 
 		 430 aa  611  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  63.03 
 
 		 428 aa  580  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  54.69 
 
 		 436 aa  500  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  48.58 
 
 		 438 aa  424  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  46.84 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  46.53 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  46.93 
 
 		 434 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  46.35 
 
 		 435 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  48.49 
 
 		 432 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  46.24 
 
 		 434 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  46.48 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  46.23 
 
 		 435 aa  411  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  46.71 
 
 		 433 aa  408  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  46.65 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  46.65 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  48.59 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  45.39 
 
 		 434 aa  408  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  44.19 
 
 		 433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  45.69 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  44.68 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  45.52 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  46.24 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  47 
 
 		 432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  46.51 
 
 		 446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  44.8 
 
 		 433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  46.21 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  45.28 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  44.63 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  44.21 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  45.05 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  44.84 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  45.75 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  45.07 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  45.79 
 
 		 431 aa  403  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  44.06 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  45.31 
 
 		 433 aa  403  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  43.59 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  45.05 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  45.05 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  46.35 
 
 		 433 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  45.28 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  43.82 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  43.82 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  44.71 
 
 		 436 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  44.03 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0440  phenylacetate-CoA ligase  45.81 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  44.47 
 
 		 433 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  45.86 
 
 		 439 aa  398  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  44.24 
 
 		 433 aa  398  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  44.81 
 
 		 433 aa  398  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  44.37 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  44.47 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  45.58 
 
 		 434 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  45 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  44.37 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  43.19 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  45.35 
 
 		 436 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  44.13 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  43.36 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  45.65 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  44.33 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  43.43 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  44.81 
 
 		 432 aa  388  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  44.06 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2630  phenylacetate-CoA ligase  45.22 
 
 		 439 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460145  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  42.32 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  44.52 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  46.19 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  44.86 
 
 		 439 aa  386  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  45.35 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  46.03 
 
 		 434 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  44 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  45.41 
 
 		 444 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  44.76 
 
 		 439 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  44.71 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  44.94 
 
 		 431 aa  378  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  46.37 
 
 		 441 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  45.31 
 
 		 444 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  44.24 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  43.59 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  44.65 
 
 		 434 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  41.88 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  42.92 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  41.2 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  44.29 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  41.51 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  44.29 
 
 		 434 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  44.52 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  44.29 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  44.52 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2617  phenylacetate-CoA ligase  44.29 
 
 		 439 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.174416 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  46.45 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2480  phenylacetate-CoA ligase  44.52 
 
 		 439 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  43.13 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  44.87 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2870  phenylacetate-CoA ligase  43.09 
 
 		 442 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>