More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06240 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  100 
 
 		 436 aa  901    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  60.6 
 
 		 436 aa  551  1e-155  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  55.17 
 
 		 435 aa  506  9.999999999999999e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  54.72 
 
 		 433 aa  483  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  52.59 
 
 		 432 aa  478  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  53.65 
 
 		 433 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  53.68 
 
 		 432 aa  463  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  53.07 
 
 		 433 aa  462  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  52.24 
 
 		 435 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  52.47 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  49.76 
 
 		 434 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  51.53 
 
 		 433 aa  457  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  51.53 
 
 		 434 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  50.94 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  50.94 
 
 		 433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  50.59 
 
 		 434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  51.65 
 
 		 434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  51.42 
 
 		 433 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  49.88 
 
 		 435 aa  450  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  51.18 
 
 		 435 aa  449  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  50.82 
 
 		 435 aa  451  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  51.65 
 
 		 434 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  51.65 
 
 		 434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  51.42 
 
 		 434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  50.94 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  48.46 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  49.65 
 
 		 438 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  48.46 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  50.35 
 
 		 439 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  48.46 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  50.23 
 
 		 448 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  50.47 
 
 		 446 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  50.82 
 
 		 444 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  48.7 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  48.37 
 
 		 432 aa  433  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  47.06 
 
 		 433 aa  434  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  47.75 
 
 		 433 aa  434  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  48.58 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  50.58 
 
 		 444 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  48.58 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  50 
 
 		 437 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  48.35 
 
 		 432 aa  430  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  50.12 
 
 		 444 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  48.82 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  48.82 
 
 		 433 aa  425  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  50.7 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  49.05 
 
 		 430 aa  425  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  48.82 
 
 		 436 aa  427  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  47.41 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  47.65 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  46.93 
 
 		 433 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  49.17 
 
 		 436 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  47.9 
 
 		 431 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  46.23 
 
 		 433 aa  421  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  47.88 
 
 		 433 aa  420  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  48.82 
 
 		 433 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  48.46 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  48.26 
 
 		 431 aa  418  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  50.59 
 
 		 439 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  50.12 
 
 		 432 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  48.58 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  46.12 
 
 		 439 aa  413  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  48.48 
 
 		 439 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  47.52 
 
 		 434 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  48.26 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  47.56 
 
 		 434 aa  408  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  45.88 
 
 		 439 aa  411  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  45.65 
 
 		 439 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  48.11 
 
 		 432 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  47.17 
 
 		 432 aa  411  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  48.04 
 
 		 434 aa  411  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  48.71 
 
 		 444 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  47.44 
 
 		 434 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  47.52 
 
 		 432 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  47.21 
 
 		 434 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  48.22 
 
 		 433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  48.34 
 
 		 434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  46.7 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  47.32 
 
 		 440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  48.23 
 
 		 441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  45.45 
 
 		 434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  48 
 
 		 445 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  48.23 
 
 		 441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  48.46 
 
 		 441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  48.46 
 
 		 444 aa  408  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  47.88 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2630  phenylacetate-CoA ligase  48.36 
 
 		 439 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460145  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2480  phenylacetate-CoA ligase  48.46 
 
 		 439 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  48.22 
 
 		 439 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2617  phenylacetate-CoA ligase  48.69 
 
 		 439 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.174416 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  47.28 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  46.03 
 
 		 437 aa  403  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1509  phenylacetate-CoA ligase  47.93 
 
 		 441 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.047551  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  47.41 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  47.32 
 
 		 440 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  47.32 
 
 		 440 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  45.86 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  47.32 
 
 		 440 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  47.51 
 
 		 436 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  48.77 
 
 		 433 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>