More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1798 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 427 aa  868    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  64.82 
 
 		 428 aa  584  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  63.61 
 
 		 415 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  62.28 
 
 		 414 aa  533  1e-150  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  62.53 
 
 		 414 aa  533  1e-150  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  62.38 
 
 		 414 aa  533  1e-150  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  62.07 
 
 		 435 aa  525  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  60.66 
 
 		 438 aa  524  1e-147  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  64.48 
 
 		 415 aa  523  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  60.64 
 
 		 413 aa  511  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  59.95 
 
 		 412 aa  486  1e-136  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  56.96 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  56.13 
 
 		 412 aa  451  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  52.26 
 
 		 694 aa  441  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0379  phenylacetate--CoA ligase  51.05 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  54.7 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  54 
 
 		 433 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  49.17 
 
 		 447 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2452  phenylacetate--CoA ligase  50.58 
 
 		 432 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  48.21 
 
 		 429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  49.41 
 
 		 433 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  49.03 
 
 		 432 aa  393  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  48.67 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  48.79 
 
 		 438 aa  392  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1721  Phenylacetate--CoA ligase  46.84 
 
 		 431 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  46.78 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  47.46 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  43.69 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  43.69 
 
 		 432 aa  381  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  44.42 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  44.79 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  46.19 
 
 		 433 aa  375  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  46 
 
 		 441 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  46.06 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  45.15 
 
 		 431 aa  375  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  43.39 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  46.43 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  44.95 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  45.79 
 
 		 445 aa  372  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  46.39 
 
 		 446 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  44.63 
 
 		 434 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  43.75 
 
 		 439 aa  368  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  45.28 
 
 		 433 aa  368  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  44.95 
 
 		 434 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  44.34 
 
 		 434 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  44.66 
 
 		 432 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  45.76 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  44.98 
 
 		 434 aa  372  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  46 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  44.26 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  43.83 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  44.63 
 
 		 434 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  45.35 
 
 		 435 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  43.65 
 
 		 432 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  44.42 
 
 		 435 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  44.12 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  44.79 
 
 		 434 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  44.87 
 
 		 434 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  46.04 
 
 		 444 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  44.47 
 
 		 434 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  43.88 
 
 		 432 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  43.88 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  43.88 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  43.88 
 
 		 432 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  43.81 
 
 		 434 aa  365  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  45.13 
 
 		 434 aa  368  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  45.87 
 
 		 436 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  44.79 
 
 		 433 aa  365  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  44.11 
 
 		 434 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  45.13 
 
 		 434 aa  365  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  43.94 
 
 		 439 aa  364  1e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  46.32 
 
 		 433 aa  365  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  43.49 
 
 		 434 aa  364  2e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  43.26 
 
 		 432 aa  363  4e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  45 
 
 		 433 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  44.32 
 
 		 435 aa  362  6e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  45.08 
 
 		 444 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  43.65 
 
 		 432 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  44.55 
 
 		 436 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  42.79 
 
 		 434 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  44.1 
 
 		 439 aa  360  2e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  43.36 
 
 		 435 aa  360  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  45.56 
 
 		 444 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  41.82 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  42.79 
 
 		 433 aa  359  6e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  44.21 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  43.83 
 
 		 433 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  42.79 
 
 		 430 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  42.55 
 
 		 433 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  45.45 
 
 		 433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  44.79 
 
 		 439 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  43.12 
 
 		 437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  44.05 
 
 		 439 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  43.12 
 
 		 437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  43.12 
 
 		 437 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  43.12 
 
 		 437 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  42 
 
 		 436 aa  356  3.9999999999999996e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  40.69 
 
 		 433 aa  356  5e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  41.2 
 
 		 431 aa  356  5.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  42.86 
 
 		 433 aa  355  7.999999999999999e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>