More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2408 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 429 aa  881    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2452  phenylacetate--CoA ligase  65.81 
 
 		 432 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  65.35 
 
 		 433 aa  578  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1721  Phenylacetate--CoA ligase  64.15 
 
 		 431 aa  568  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0379  phenylacetate--CoA ligase  63.11 
 
 		 432 aa  555  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  56.78 
 
 		 694 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2338  Phenylacetate--CoA ligase  59.48 
 
 		 426 aa  511  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  56.41 
 
 		 447 aa  501  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  56.84 
 
 		 433 aa  499  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  56.06 
 
 		 433 aa  487  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  49.41 
 
 		 435 aa  429  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  48.82 
 
 		 438 aa  430  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  49.26 
 
 		 414 aa  425  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  49.25 
 
 		 414 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  49.25 
 
 		 415 aa  422  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  48.28 
 
 		 414 aa  419  1e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  48.21 
 
 		 427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  46.41 
 
 		 413 aa  398  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  45.61 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  50 
 
 		 412 aa  387  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  46.39 
 
 		 415 aa  386  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  46.97 
 
 		 412 aa  358  9e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  43.23 
 
 		 433 aa  355  6.999999999999999e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  44.94 
 
 		 413 aa  350  3e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  42.62 
 
 		 433 aa  349  6e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  42.36 
 
 		 432 aa  344  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  42.82 
 
 		 432 aa  344  2e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  42.04 
 
 		 434 aa  341  2e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  41.11 
 
 		 433 aa  340  2e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  43.57 
 
 		 438 aa  340  4e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  42 
 
 		 432 aa  339  5e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  43.36 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  42.48 
 
 		 432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  42 
 
 		 432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  40.81 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  42.48 
 
 		 432 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  42.89 
 
 		 432 aa  336  5e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  42.24 
 
 		 432 aa  335  7e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  42.42 
 
 		 434 aa  335  7e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  41.63 
 
 		 446 aa  335  9e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  41.65 
 
 		 428 aa  334  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  41.69 
 
 		 434 aa  333  5e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  41.51 
 
 		 432 aa  331  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  40.09 
 
 		 434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  41.63 
 
 		 433 aa  329  7e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  40.38 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  41.33 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  41.19 
 
 		 429 aa  327  3e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  40.81 
 
 		 444 aa  326  6e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  40.81 
 
 		 444 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  40.81 
 
 		 434 aa  325  9e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  40.14 
 
 		 423 aa  325  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2486  phenylacetate-CoA ligase  41.75 
 
 		 450 aa  325  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  40.47 
 
 		 430 aa  324  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  43.02 
 
 		 445 aa  323  3e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  42.14 
 
 		 435 aa  323  3e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  40.33 
 
 		 431 aa  323  3e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  41.43 
 
 		 444 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  41.13 
 
 		 434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  40.87 
 
 		 437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  40.67 
 
 		 432 aa  319  5e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  39.57 
 
 		 433 aa  319  5e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  41.09 
 
 		 435 aa  319  5e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  39.2 
 
 		 433 aa  319  6e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  41.63 
 
 		 444 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  41.22 
 
 		 443 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  41.61 
 
 		 434 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1908  phenylacetate-CoA ligase  41.94 
 
 		 446 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26570  phenylacetate-CoA ligase  41.27 
 
 		 448 aa  318  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.123505 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  41.72 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  41.72 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  43.1 
 
 		 444 aa  318  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  41.72 
 
 		 437 aa  317  4e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  40.38 
 
 		 435 aa  316  5e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  39.01 
 
 		 433 aa  316  6e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  38 
 
 		 435 aa  316  6e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  41.12 
 
 		 439 aa  316  6e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  40.33 
 
 		 434 aa  315  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  41.49 
 
 		 437 aa  315  9e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2897  Phenylacetate--CoA ligase  40.87 
 
 		 428 aa  315  9e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  40.57 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  40.09 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  39.95 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  41 
 
 		 441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  38.95 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  38.81 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  41.19 
 
 		 430 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  40.28 
 
 		 434 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  39.49 
 
 		 434 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  39.29 
 
 		 434 aa  312  9e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  39.91 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  40.86 
 
 		 432 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  40.62 
 
 		 434 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  39.05 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1029  Phenylacetate--CoA ligase  42.49 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  39.29 
 
 		 439 aa  311  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  40.43 
 
 		 430 aa  311  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  39.38 
 
 		 433 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  41.57 
 
 		 434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  41.55 
 
 		 449 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>