More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1316 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  73.66 
 
 		 435 aa  638    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  95.41 
 
 		 414 aa  817    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 414 aa  851    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  93 
 
 		 414 aa  798    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  81.49 
 
 		 415 aa  692    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  73.83 
 
 		 438 aa  629  1e-179  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  65.93 
 
 		 413 aa  567  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  66.5 
 
 		 415 aa  559  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  61.95 
 
 		 412 aa  537  1e-151  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  62.53 
 
 		 427 aa  533  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  60.25 
 
 		 428 aa  525  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  59.85 
 
 		 413 aa  524  1e-147  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  59.07 
 
 		 412 aa  494  9.999999999999999e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  52.61 
 
 		 694 aa  432  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0379  phenylacetate--CoA ligase  51.36 
 
 		 432 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  48.28 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  49.51 
 
 		 433 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  49.38 
 
 		 447 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2452  phenylacetate--CoA ligase  50.37 
 
 		 432 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  48.79 
 
 		 433 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  48.64 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1721  Phenylacetate--CoA ligase  47.19 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  47.32 
 
 		 434 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  46.7 
 
 		 433 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  46.83 
 
 		 434 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  46.59 
 
 		 433 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  45.15 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  46.21 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  45.48 
 
 		 434 aa  381  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  45.99 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  45.37 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  45.72 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  47.29 
 
 		 433 aa  376  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  46.83 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  45.68 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  44.85 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  45.5 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  45.23 
 
 		 433 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  45.23 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  44.94 
 
 		 439 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  45.39 
 
 		 434 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  45.12 
 
 		 433 aa  371  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  46.1 
 
 		 432 aa  368  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  45.96 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  44.61 
 
 		 438 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2480  phenylacetate-CoA ligase  45.19 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2617  phenylacetate-CoA ligase  45.19 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.174416 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  43.36 
 
 		 434 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  43.1 
 
 		 434 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  43.52 
 
 		 435 aa  368  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2630  phenylacetate-CoA ligase  44.69 
 
 		 439 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460145  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  44.85 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  45.99 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  44.1 
 
 		 444 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  45.34 
 
 		 439 aa  365  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  45.99 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  44.72 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  45.12 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  41.56 
 
 		 433 aa  364  1e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  43.03 
 
 		 434 aa  363  4e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  42.89 
 
 		 433 aa  363  4e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  44.01 
 
 		 444 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  44.39 
 
 		 431 aa  362  6e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  44.88 
 
 		 436 aa  362  7.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2338  Phenylacetate--CoA ligase  45.06 
 
 		 426 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  44.84 
 
 		 431 aa  362  8e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  42.93 
 
 		 432 aa  362  8e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  43.63 
 
 		 434 aa  362  8e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  45.52 
 
 		 433 aa  362  9e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  43.45 
 
 		 444 aa  362  9e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  44.36 
 
 		 432 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  42.68 
 
 		 432 aa  361  1e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  43.38 
 
 		 433 aa  361  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  44.03 
 
 		 434 aa  361  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  42.93 
 
 		 432 aa  361  2e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  42.16 
 
 		 432 aa  361  2e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  42.89 
 
 		 437 aa  360  3e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  44.12 
 
 		 434 aa  358  9e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  43.1 
 
 		 434 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  42.65 
 
 		 431 aa  356  3.9999999999999996e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  44 
 
 		 432 aa  356  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  43.63 
 
 		 434 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  42.07 
 
 		 432 aa  354  1e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3117  phenylacetate-CoA ligase  42.86 
 
 		 434 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0603128  normal  0.0548798 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  43.6 
 
 		 433 aa  355  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  45.26 
 
 		 433 aa  353  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  44 
 
 		 430 aa  354  2e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  42.96 
 
 		 433 aa  354  2e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  43.66 
 
 		 433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  44.15 
 
 		 433 aa  352  5e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  42.79 
 
 		 434 aa  352  5e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  42.58 
 
 		 439 aa  352  7e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  42.05 
 
 		 432 aa  352  7e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  43 
 
 		 432 aa  352  8e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  43.73 
 
 		 434 aa  352  8e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  41.99 
 
 		 439 aa  352  1e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  41.95 
 
 		 429 aa  351  1e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  43 
 
 		 449 aa  351  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  42.93 
 
 		 448 aa  349  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  42.68 
 
 		 433 aa  350  4e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>