More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2897 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2897  Phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 
428 aa  860    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1029  Phenylacetate--CoA ligase  81.82 
 
 
429 aa  690    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  78.01 
 
 
427 aa  659    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  52.53 
 
 
435 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  53.52 
 
 
432 aa  485  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  52.76 
 
 
435 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  53.52 
 
 
432 aa  482  1e-135  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  52.08 
 
 
434 aa  481  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  51.87 
 
 
434 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  53.52 
 
 
432 aa  479  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  52.21 
 
 
435 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  54.21 
 
 
433 aa  479  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  51.17 
 
 
434 aa  477  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  51.28 
 
 
433 aa  474  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  52.11 
 
 
433 aa  474  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  51.05 
 
 
433 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  53.41 
 
 
434 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  51.64 
 
 
433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  52.82 
 
 
433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  52 
 
 
435 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  52.82 
 
 
433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  52.1 
 
 
433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  52.58 
 
 
433 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  52.53 
 
 
433 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  52.58 
 
 
432 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  53.02 
 
 
444 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  52.67 
 
 
444 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  52.82 
 
 
435 aa  462  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  51.98 
 
 
432 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  51.64 
 
 
436 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  55.39 
 
 
432 aa  459  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  50.23 
 
 
434 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  51.98 
 
 
433 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  50.58 
 
 
444 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  51.64 
 
 
432 aa  456  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  51.25 
 
 
449 aa  456  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  49.42 
 
 
433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  49.42 
 
 
433 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  50.34 
 
 
449 aa  453  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  50.69 
 
 
443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  51.4 
 
 
446 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  49.42 
 
 
433 aa  451  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  50.47 
 
 
434 aa  450  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  53.68 
 
 
449 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  52.45 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  51.06 
 
 
434 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  50.35 
 
 
444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  50.47 
 
 
434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  51.41 
 
 
432 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  50.23 
 
 
433 aa  442  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  50.94 
 
 
445 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  51.16 
 
 
431 aa  442  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  51.28 
 
 
439 aa  442  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  53.52 
 
 
438 aa  443  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  49.88 
 
 
439 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2486  phenylacetate-CoA ligase  52 
 
 
450 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773414  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  50.35 
 
 
448 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  49.3 
 
 
440 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  49.65 
 
 
434 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  51.76 
 
 
434 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  51.76 
 
 
434 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0440  phenylacetate-CoA ligase  51.29 
 
 
436 aa  441  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  49.3 
 
 
440 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  49.3 
 
 
440 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  49.18 
 
 
433 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  50.47 
 
 
437 aa  437  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  47.81 
 
 
433 aa  437  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  49.18 
 
 
439 aa  436  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  50.7 
 
 
432 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  50.7 
 
 
432 aa  435  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  50.7 
 
 
430 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  50.23 
 
 
437 aa  435  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  51.41 
 
 
439 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  50 
 
 
443 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  49.07 
 
 
440 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  50.71 
 
 
434 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  51.17 
 
 
432 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  49.77 
 
 
432 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  49.3 
 
 
440 aa  438  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  51.17 
 
 
432 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  51.17 
 
 
432 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  50.23 
 
 
437 aa  435  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  50.47 
 
 
437 aa  436  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  48.83 
 
 
431 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26570  phenylacetate-CoA ligase  52.15 
 
 
448 aa  433  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.123505 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  50 
 
 
437 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0986  phenylacetate-CoA ligase  50.94 
 
 
435 aa  432  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337709  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  50.94 
 
 
432 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  48.24 
 
 
439 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  49.41 
 
 
436 aa  433  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  48.36 
 
 
440 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  48.95 
 
 
439 aa  433  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  50.59 
 
 
434 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  50.12 
 
 
434 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3117  phenylacetate-CoA ligase  51.54 
 
 
434 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0603128  normal  0.0548798 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  49.3 
 
 
434 aa  430  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1392  phenylacetate-CoA ligase  47.92 
 
 
441 aa  431  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276204  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  50.7 
 
 
439 aa  431  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  50.59 
 
 
434 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  48.13 
 
 
440 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>