More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27480 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  100 
 
 		 412 aa  849    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  65.05 
 
 		 412 aa  570  1e-161  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  64.89 
 
 		 413 aa  563  1.0000000000000001e-159  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  59.56 
 
 		 414 aa  499  1e-140  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  59.07 
 
 		 414 aa  497  1e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  59.07 
 
 		 414 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  60.31 
 
 		 415 aa  487  1e-136  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  57.18 
 
 		 415 aa  482  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  56.45 
 
 		 413 aa  484  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  58.84 
 
 		 435 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  57.56 
 
 		 438 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  56.13 
 
 		 427 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  54.99 
 
 		 428 aa  443  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  48.83 
 
 		 694 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0379  phenylacetate--CoA ligase  52.78 
 
 		 432 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  48.71 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  50.36 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  50 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  50.63 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1721  Phenylacetate--CoA ligase  48.99 
 
 		 431 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  47.99 
 
 		 433 aa  371  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2452  phenylacetate--CoA ligase  47.32 
 
 		 432 aa  368  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2338  Phenylacetate--CoA ligase  46.75 
 
 		 426 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  45.28 
 
 		 434 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  45.73 
 
 		 432 aa  353  4e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  46.3 
 
 		 434 aa  353  5e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  43 
 
 		 436 aa  352  1e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  45.17 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  43.6 
 
 		 432 aa  342  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  40.82 
 
 		 435 aa  341  1e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  42.61 
 
 		 434 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  42.36 
 
 		 430 aa  338  7e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  43.1 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  41.55 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  43.24 
 
 		 435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  43.48 
 
 		 435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  43.1 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  43.5 
 
 		 432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  43.34 
 
 		 432 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  41.29 
 
 		 428 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  44.58 
 
 		 433 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  43.24 
 
 		 435 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  43.1 
 
 		 433 aa  335  9e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  43.48 
 
 		 434 aa  333  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  42.86 
 
 		 438 aa  333  3e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  43.34 
 
 		 433 aa  333  5e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  43.61 
 
 		 436 aa  332  8e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  43.91 
 
 		 434 aa  332  9e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  43.48 
 
 		 434 aa  331  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  41.89 
 
 		 439 aa  331  2e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  41.12 
 
 		 436 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  43.83 
 
 		 432 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  41.65 
 
 		 439 aa  330  4e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  42.86 
 
 		 436 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  41.65 
 
 		 439 aa  329  6e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  41.65 
 
 		 432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  43.32 
 
 		 432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  42.17 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  43 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  41.89 
 
 		 432 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  42.65 
 
 		 439 aa  326  5e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  43.07 
 
 		 432 aa  325  7e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  41.89 
 
 		 432 aa  325  7e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  41.99 
 
 		 431 aa  325  9e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  43.34 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  43.32 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  42.51 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  40.68 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  43.1 
 
 		 434 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  42.17 
 
 		 439 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2630  phenylacetate-CoA ligase  42.45 
 
 		 439 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460145  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2480  phenylacetate-CoA ligase  42.17 
 
 		 439 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  40.63 
 
 		 434 aa  322  7e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  40.85 
 
 		 432 aa  322  8e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  42.51 
 
 		 433 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  42.86 
 
 		 433 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  42.27 
 
 		 434 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  43.24 
 
 		 433 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  42.96 
 
 		 449 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  44.56 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  41.85 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2617  phenylacetate-CoA ligase  41.93 
 
 		 439 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.174416 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  41.71 
 
 		 437 aa  319  5e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  40.92 
 
 		 434 aa  318  9e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  41.4 
 
 		 434 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  41.4 
 
 		 434 aa  318  1e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  41.56 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  42.13 
 
 		 435 aa  318  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  41.89 
 
 		 431 aa  317  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  41.69 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  41.36 
 
 		 423 aa  317  3e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  41.16 
 
 		 432 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  42.37 
 
 		 433 aa  317  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  42.37 
 
 		 433 aa  316  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  43.47 
 
 		 435 aa  316  4e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  40.58 
 
 		 433 aa  316  4e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  42.46 
 
 		 433 aa  316  5e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  42.37 
 
 		 433 aa  316  5e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  41.4 
 
 		 432 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  43 
 
 		 433 aa  316  5e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>