More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1010 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 
415 aa  845    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  67.16 
 
 
414 aa  564  1e-160  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  66.18 
 
 
413 aa  561  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  67.25 
 
 
414 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  66.5 
 
 
414 aa  559  1e-158  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  67 
 
 
415 aa  557  1e-157  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  64.25 
 
 
435 aa  535  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  64.48 
 
 
427 aa  523  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  63 
 
 
438 aa  522  1e-147  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  64.69 
 
 
412 aa  523  1e-147  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  60.84 
 
 
413 aa  508  1e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  58.19 
 
 
428 aa  491  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  57.18 
 
 
412 aa  482  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  51.99 
 
 
694 aa  430  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  51.97 
 
 
433 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2452  phenylacetate--CoA ligase  51.87 
 
 
432 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  50.86 
 
 
433 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0379  phenylacetate--CoA ligase  49.16 
 
 
432 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  50.5 
 
 
433 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  48.14 
 
 
447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1721  Phenylacetate--CoA ligase  49.75 
 
 
431 aa  398  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  45.37 
 
 
432 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  46.39 
 
 
429 aa  386  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  44.26 
 
 
434 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  44.66 
 
 
432 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  45.71 
 
 
434 aa  381  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  47.06 
 
 
435 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  44.6 
 
 
432 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  44.66 
 
 
432 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  46.32 
 
 
433 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  43.91 
 
 
432 aa  378  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  46.43 
 
 
433 aa  378  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  46.43 
 
 
433 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  44.18 
 
 
432 aa  378  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  45 
 
 
435 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  45.95 
 
 
435 aa  375  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  45.11 
 
 
433 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  42.99 
 
 
433 aa  374  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  45 
 
 
435 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  44.58 
 
 
430 aa  373  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  46.91 
 
 
433 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  43.06 
 
 
434 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  45.95 
 
 
434 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  43.2 
 
 
432 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  45.58 
 
 
432 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  43.91 
 
 
438 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  43.91 
 
 
432 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  45.95 
 
 
434 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  45.7 
 
 
434 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  42.76 
 
 
433 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  43.91 
 
 
434 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  45.13 
 
 
433 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  45.07 
 
 
432 aa  365  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  45.32 
 
 
433 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  43.81 
 
 
434 aa  368  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  44.97 
 
 
429 aa  365  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  42.04 
 
 
433 aa  365  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  42.52 
 
 
432 aa  366  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  43.84 
 
 
433 aa  366  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  41.81 
 
 
432 aa  366  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  46.29 
 
 
431 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  42.96 
 
 
431 aa  364  1e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  44.42 
 
 
434 aa  364  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  42.99 
 
 
433 aa  363  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  42.52 
 
 
433 aa  363  3e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2338  Phenylacetate--CoA ligase  45.78 
 
 
426 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  43.36 
 
 
435 aa  361  1e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  43.1 
 
 
433 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  44.64 
 
 
439 aa  360  3e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  43.33 
 
 
439 aa  360  4e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  43.68 
 
 
436 aa  359  4e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  41.9 
 
 
423 aa  359  5e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  43.81 
 
 
441 aa  359  6e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  43.23 
 
 
433 aa  359  6e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  42.05 
 
 
428 aa  358  7e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  39.95 
 
 
432 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  43.44 
 
 
439 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  42.99 
 
 
433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  44.53 
 
 
434 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  43.44 
 
 
439 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  42.89 
 
 
434 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  43.11 
 
 
436 aa  356  5e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  43.87 
 
 
429 aa  356  5e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  42.61 
 
 
436 aa  354  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  42.57 
 
 
444 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  40.91 
 
 
436 aa  353  2e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  41.81 
 
 
433 aa  354  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  41.35 
 
 
437 aa  353  4e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  42.36 
 
 
433 aa  352  5e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  42.04 
 
 
436 aa  352  7e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  44.87 
 
 
433 aa  352  7e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  42.86 
 
 
437 aa  352  8e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  42.86 
 
 
437 aa  352  8e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  43.44 
 
 
435 aa  352  8e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  42.18 
 
 
446 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  42.86 
 
 
437 aa  351  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  42.22 
 
 
434 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  41.87 
 
 
433 aa  351  2e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  42.61 
 
 
437 aa  350  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  42.65 
 
 
434 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>