More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2115 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  100 
 
 		 447 aa  929    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  73.1 
 
 		 694 aa  689    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0379  phenylacetate--CoA ligase  62.5 
 
 		 432 aa  571  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  59.95 
 
 		 433 aa  548  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  59.72 
 
 		 433 aa  542  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  56.41 
 
 		 429 aa  501  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  56.18 
 
 		 433 aa  501  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2452  phenylacetate--CoA ligase  57.41 
 
 		 432 aa  497  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1721  Phenylacetate--CoA ligase  54.5 
 
 		 431 aa  485  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2338  Phenylacetate--CoA ligase  52.68 
 
 		 426 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  50.12 
 
 		 414 aa  419  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  49.88 
 
 		 414 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  49.38 
 
 		 414 aa  413  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  50 
 
 		 415 aa  414  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  49.17 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  48.71 
 
 		 438 aa  410  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  48.14 
 
 		 415 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  47.66 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  48.71 
 
 		 412 aa  400  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  46.39 
 
 		 413 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  48.49 
 
 		 413 aa  384  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  46.08 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  45.73 
 
 		 412 aa  370  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  43.47 
 
 		 438 aa  344  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  43.6 
 
 		 432 aa  342  5.999999999999999e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  42.39 
 
 		 432 aa  341  2e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  41.87 
 
 		 433 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  42.32 
 
 		 432 aa  338  9e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  44.08 
 
 		 434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  44.66 
 
 		 434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  42.43 
 
 		 435 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  41.81 
 
 		 432 aa  335  9e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  43.06 
 
 		 433 aa  334  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  43.02 
 
 		 446 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  40.88 
 
 		 432 aa  333  3e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  40.24 
 
 		 431 aa  333  3e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  40.88 
 
 		 432 aa  333  4e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  42.65 
 
 		 433 aa  332  6e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  41.33 
 
 		 434 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  42.96 
 
 		 444 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  42.42 
 
 		 435 aa  330  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  42.62 
 
 		 444 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  40.14 
 
 		 430 aa  331  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  42.21 
 
 		 439 aa  330  3e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  40.91 
 
 		 428 aa  330  3e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  42.42 
 
 		 435 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  42.04 
 
 		 432 aa  330  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  43.33 
 
 		 444 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  41.33 
 
 		 432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  43.4 
 
 		 435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  41.26 
 
 		 434 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  42.99 
 
 		 435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  40.91 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  39.55 
 
 		 436 aa  327  4.0000000000000003e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  40.75 
 
 		 439 aa  326  5e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  42.58 
 
 		 432 aa  326  5e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  41.71 
 
 		 437 aa  326  6e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  39.62 
 
 		 433 aa  325  9e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  41.47 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  41.47 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  41.94 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  41.47 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  42.35 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  42.86 
 
 		 434 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  40.65 
 
 		 432 aa  323  4e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  41.43 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  41.73 
 
 		 439 aa  323  4e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  42.79 
 
 		 436 aa  322  6e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  40.71 
 
 		 434 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  42.65 
 
 		 433 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  41.29 
 
 		 432 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  39.34 
 
 		 433 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  40.85 
 
 		 437 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  41.22 
 
 		 433 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  39.81 
 
 		 433 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  41.61 
 
 		 433 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  41.29 
 
 		 432 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  41.47 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  41.19 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  39.39 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  42.08 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  40.53 
 
 		 434 aa  319  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  41.51 
 
 		 435 aa  319  7.999999999999999e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  39.34 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  41.01 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  40.81 
 
 		 434 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  41.3 
 
 		 429 aa  318  2e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  41 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  41.23 
 
 		 434 aa  316  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  41.15 
 
 		 432 aa  316  4e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  41.29 
 
 		 432 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  41.29 
 
 		 432 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  41.05 
 
 		 432 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  40.52 
 
 		 434 aa  316  5e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  39.24 
 
 		 435 aa  315  9.999999999999999e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  41.05 
 
 		 432 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  41.23 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  40.48 
 
 		 431 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  40.56 
 
 		 432 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  39.72 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>