More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0379 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0379  phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 432 aa  892    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  62.15 
 
 		 694 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  62.65 
 
 		 433 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  63.34 
 
 		 433 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  62.5 
 
 		 447 aa  571  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  63.11 
 
 		 429 aa  555  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2452  phenylacetate--CoA ligase  62.53 
 
 		 432 aa  552  1e-156  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  61.72 
 
 		 433 aa  545  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1721  Phenylacetate--CoA ligase  60.62 
 
 		 431 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2338  Phenylacetate--CoA ligase  53.5 
 
 		 426 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  51.05 
 
 		 427 aa  442  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  52.2 
 
 		 438 aa  443  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  51.19 
 
 		 435 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  51.61 
 
 		 414 aa  434  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  52.99 
 
 		 414 aa  434  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  51.62 
 
 		 415 aa  428  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  51.36 
 
 		 414 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  50.96 
 
 		 428 aa  425  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  49.28 
 
 		 413 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  49.16 
 
 		 415 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  52.78 
 
 		 412 aa  410  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  49.37 
 
 		 413 aa  391  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  47.22 
 
 		 412 aa  383  1e-105  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  42.48 
 
 		 433 aa  350  3e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  43.63 
 
 		 435 aa  347  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  42.08 
 
 		 432 aa  342  1e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  43.6 
 
 		 435 aa  341  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  43.47 
 
 		 438 aa  341  2e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  42.76 
 
 		 432 aa  341  2e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  44.19 
 
 		 446 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  42.32 
 
 		 432 aa  340  4e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  43.63 
 
 		 434 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  42.65 
 
 		 433 aa  338  9e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  42.89 
 
 		 435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  40.88 
 
 		 434 aa  336  5e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  41.84 
 
 		 432 aa  336  5e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  43.06 
 
 		 434 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  42.69 
 
 		 434 aa  335  7e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  41.41 
 
 		 436 aa  335  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  40.9 
 
 		 431 aa  335  1e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  42.52 
 
 		 432 aa  334  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  40.67 
 
 		 428 aa  334  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  43.26 
 
 		 432 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  42.45 
 
 		 434 aa  333  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  42.25 
 
 		 432 aa  333  4e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  42.22 
 
 		 433 aa  333  5e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  42.62 
 
 		 437 aa  333  5e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  43.47 
 
 		 434 aa  333  5e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  41.47 
 
 		 435 aa  332  6e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  43.4 
 
 		 444 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  43.26 
 
 		 434 aa  332  9e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  42.39 
 
 		 437 aa  332  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  42.39 
 
 		 437 aa  331  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  42.39 
 
 		 437 aa  331  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  42.28 
 
 		 434 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  43.5 
 
 		 432 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  43.03 
 
 		 432 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  42.08 
 
 		 433 aa  330  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  41.75 
 
 		 435 aa  330  4e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  41.61 
 
 		 433 aa  330  4e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  43.26 
 
 		 432 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  43.26 
 
 		 432 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  41.88 
 
 		 432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  43.03 
 
 		 432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  42.35 
 
 		 436 aa  328  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  42.55 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  41.37 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  42.14 
 
 		 432 aa  326  5e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  41.81 
 
 		 432 aa  326  5e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  42.18 
 
 		 434 aa  326  6e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  40.09 
 
 		 439 aa  326  6e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  41.41 
 
 		 434 aa  326  6e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  40.43 
 
 		 434 aa  325  9e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  41.88 
 
 		 444 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  41.37 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  42.42 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  43.26 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  41.94 
 
 		 435 aa  323  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  40.89 
 
 		 433 aa  322  6e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  42.28 
 
 		 434 aa  322  7e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  40.52 
 
 		 436 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  39.62 
 
 		 433 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2630  phenylacetate-CoA ligase  42.15 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460145  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  40.76 
 
 		 432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  39.95 
 
 		 423 aa  320  3e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3117  phenylacetate-CoA ligase  42.52 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0603128  normal  0.0548798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  39.81 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  40.19 
 
 		 430 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  41.37 
 
 		 434 aa  319  6e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  41.71 
 
 		 434 aa  318  9e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  41.45 
 
 		 436 aa  318  9e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  40.75 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2480  phenylacetate-CoA ligase  41.18 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  40.8 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1509  phenylacetate-CoA ligase  42.86 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.047551  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  42.52 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  41.23 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  40.24 
 
 		 439 aa  317  2e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  40.94 
 
 		 439 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  40.94 
 
 		 435 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>