More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0950 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  82.68 
 
 		 433 aa  750    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  100 
 
 		 433 aa  887    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0379  phenylacetate--CoA ligase  63.34 
 
 		 432 aa  575  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  59.72 
 
 		 447 aa  542  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  58 
 
 		 694 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  59.57 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2452  phenylacetate--CoA ligase  59.21 
 
 		 432 aa  504  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  56.84 
 
 		 429 aa  499  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1721  Phenylacetate--CoA ligase  57.78 
 
 		 431 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  54.7 
 
 		 427 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  51.07 
 
 		 435 aa  432  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2338  Phenylacetate--CoA ligase  52.3 
 
 		 426 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  50.36 
 
 		 413 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  49.88 
 
 		 414 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  49.27 
 
 		 414 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  50.86 
 
 		 415 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  48.79 
 
 		 414 aa  410  1e-113  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  48.03 
 
 		 415 aa  410  1e-113  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  50.87 
 
 		 438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  50.36 
 
 		 412 aa  399  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  49.38 
 
 		 412 aa  389  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  48.09 
 
 		 413 aa  387  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  47.14 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  43.76 
 
 		 435 aa  347  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  41.27 
 
 		 434 aa  340  2e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  42.32 
 
 		 438 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  43.16 
 
 		 432 aa  339  4e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  40.52 
 
 		 433 aa  335  7e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  40.9 
 
 		 432 aa  335  9e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  43.4 
 
 		 435 aa  333  3e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  42.32 
 
 		 435 aa  332  8e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  42.62 
 
 		 444 aa  328  8e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  42.08 
 
 		 434 aa  326  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  41.61 
 
 		 434 aa  325  7e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  39.62 
 
 		 432 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  41.71 
 
 		 435 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  41.81 
 
 		 437 aa  324  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  41.46 
 
 		 432 aa  323  3e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  39.29 
 
 		 433 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  42.65 
 
 		 446 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  39.95 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  39.39 
 
 		 432 aa  320  3e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  42.09 
 
 		 434 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  41.23 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  39.15 
 
 		 432 aa  319  5e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  39.68 
 
 		 436 aa  319  5e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  40.9 
 
 		 433 aa  319  7e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  41.92 
 
 		 444 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  42.22 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  38.68 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  41.71 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  41.55 
 
 		 434 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  39.12 
 
 		 430 aa  317  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  42.18 
 
 		 444 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  37.79 
 
 		 433 aa  317  4e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  39.95 
 
 		 433 aa  316  4e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  38.21 
 
 		 431 aa  316  5e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  40.93 
 
 		 432 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  39.06 
 
 		 435 aa  316  6e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  40.44 
 
 		 428 aa  316  7e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  41.3 
 
 		 434 aa  315  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  41.4 
 
 		 432 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  40.93 
 
 		 432 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  40.05 
 
 		 434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  40.57 
 
 		 433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  41.16 
 
 		 432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  41.16 
 
 		 432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  41.16 
 
 		 432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  37.32 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  40.19 
 
 		 432 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  37.97 
 
 		 433 aa  312  5.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  39.48 
 
 		 434 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  40.09 
 
 		 429 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  39.1 
 
 		 434 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  37.74 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  40.14 
 
 		 432 aa  311  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  39.95 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  40.66 
 
 		 434 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  40.75 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  39.21 
 
 		 432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  39.15 
 
 		 432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  40.52 
 
 		 429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  40.41 
 
 		 434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  41.22 
 
 		 442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  41.27 
 
 		 434 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  39.81 
 
 		 433 aa  309  5.9999999999999995e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  39.81 
 
 		 436 aa  309  8e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  41.3 
 
 		 434 aa  309  8e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  40.37 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  40.18 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  38.89 
 
 		 437 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  39.42 
 
 		 436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  38.89 
 
 		 437 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  38.89 
 
 		 437 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  40.47 
 
 		 432 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  40.37 
 
 		 434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  38.68 
 
 		 433 aa  306  3e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  39.95 
 
 		 434 aa  306  3e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  39.91 
 
 		 439 aa  307  3e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  37.74 
 
 		 432 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>