More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3223 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3223  ABC transporter related  100 
 
 		 573 aa  1108    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  39.11 
 
 		 822 aa  306  7e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  38.61 
 
 		 823 aa  291  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  38.46 
 
 		 823 aa  291  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  38.61 
 
 		 827 aa  290  6e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  37.73 
 
 		 828 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  37.05 
 
 		 484 aa  280  6e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1048  ABC transporter related  37.41 
 
 		 549 aa  280  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3456  ABC transporter related  38.76 
 
 		 1302 aa  273  8.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.66499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  35.92 
 
 		 832 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  35.17 
 
 		 842 aa  267  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  36.41 
 
 		 830 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3584  ABC transporter related  36.79 
 
 		 873 aa  265  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282341  normal  0.46326 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0067  ABC transporter related  34.86 
 
 		 502 aa  259  7e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  33.87 
 
 		 555 aa  258  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1818  ABC transporter related  34.66 
 
 		 501 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.013948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4765  ABC transporter related  34.36 
 
 		 502 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.991546  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0382  ABC transporter related  39.58 
 
 		 538 aa  254  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0485  ABC transporter related  34.4 
 
 		 490 aa  254  4.0000000000000004e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  34.23 
 
 		 852 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  34.72 
 
 		 840 aa  252  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  34.25 
 
 		 840 aa  250  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  34.45 
 
 		 859 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  33.98 
 
 		 838 aa  246  8e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  32.89 
 
 		 863 aa  243  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1938  ABC transporter related  32.3 
 
 		 494 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323376  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  32.83 
 
 		 840 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0705  ABC transporter related  34.64 
 
 		 505 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4092  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.64 
 
 		 489 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0763  ABC transporter related  36.22 
 
 		 504 aa  228  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3488  ABC transporter related protein  50.6 
 
 		 244 aa  225  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  30.94 
 
 		 536 aa  218  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4016  ABC transporter related  46.79 
 
 		 272 aa  216  8e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8310  ABC transporter related  48.8 
 
 		 277 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.575602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3395  ABC transporter related  50 
 
 		 956 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4040  ABC transporter related  51.2 
 
 		 277 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  36.8 
 
 		 256 aa  206  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3868  ABC transporter related  47.22 
 
 		 237 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0854  ABC transporter related  46.4 
 
 		 267 aa  206  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  46.33 
 
 		 257 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  41.27 
 
 		 259 aa  204  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5665  ABC transporter related  47.22 
 
 		 283 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  41.83 
 
 		 259 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  41.27 
 
 		 264 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  41.27 
 
 		 259 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 252 aa  200  5e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  40.87 
 
 		 265 aa  200  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.6 
 
 		 255 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  41.57 
 
 		 260 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.2 
 
 		 255 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.2 
 
 		 255 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.2 
 
 		 255 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4041  ABC transporter related  45.75 
 
 		 260 aa  197  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  40.82 
 
 		 250 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4736  ABC transporter related  45.35 
 
 		 268 aa  196  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  41.96 
 
 		 250 aa  196  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  40.08 
 
 		 265 aa  196  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2268  ABC transporter related  46.09 
 
 		 262 aa  196  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2952  ABC transporter related  47.01 
 
 		 930 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40 
 
 		 255 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  42.53 
 
 		 255 aa  194  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.6 
 
 		 255 aa  194  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  44.05 
 
 		 253 aa  193  6e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  37.45 
 
 		 288 aa  193  7e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 		 255 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  42.31 
 
 		 278 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2141  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.83 
 
 		 257 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558111  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40 
 
 		 255 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.6 
 
 		 255 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0775  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.83 
 
 		 257 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0865  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.83 
 
 		 257 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154557  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  42.75 
 
 		 250 aa  192  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  41.15 
 
 		 262 aa  192  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  37.45 
 
 		 270 aa  192  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  41.57 
 
 		 250 aa  192  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 254 aa  192  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  41.98 
 
 		 253 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1981  ABC transporter related protein  46.5 
 
 		 249 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1836  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.04 
 
 		 257 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2737  ABC transporter related  40.41 
 
 		 268 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3626  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 257 aa  191  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3396  ABC transporter related  43.1 
 
 		 229 aa  190  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  39.53 
 
 		 255 aa  190  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  40.24 
 
 		 265 aa  191  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.6 
 
 		 251 aa  190  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  38.85 
 
 		 286 aa  190  5.999999999999999e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  41.34 
 
 		 259 aa  190  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  41.8 
 
 		 255 aa  189  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0483  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  39.52 
 
 		 261 aa  189  8e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1731  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 250 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.385774  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.89 
 
 		 256 aa  189  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.98 
 
 		 254 aa  189  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1384  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.8 
 
 		 255 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818364  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0654  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.69 
 
 		 257 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3869  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.2 
 
 		 256 aa  189  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5271  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.69 
 
 		 257 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  40.39 
 
 		 258 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  35.34 
 
 		 284 aa  188  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3351  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.69 
 
 		 257 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5016  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.69 
 
 		 257 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.836649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>