More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7507 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7507  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 290 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1174  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.4 
 
 		 289 aa  222  6e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2538  inner-membrane translocator  43.4 
 
 		 285 aa  195  9e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4454  inner-membrane translocator  33.09 
 
 		 288 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242993  normal  0.0168386 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0056  ABC transporter, permease protein  33.83 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2666  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  33.46 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2713  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3288  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1839  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0055  ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1980  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component-like protein  30.62 
 
 		 898 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6117  branched chain amino acid ABC transporter permease  31.71 
 
 		 291 aa  95.9  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.94 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1003  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0048  branched chain amino acid ABC transporter permease  32.66 
 
 		 264 aa  90.5  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4820  inner-membrane translocator  29.01 
 
 		 290 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0225289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0268  branched chain amino acid ABC transporter permease  32.26 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3583  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.967515  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  29.05 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  26.33 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  29.47 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2989  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.25 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115957  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  29.37 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  27.18 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2113  inner-membrane translocator  31.78 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.216632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4737  ABC transporter related  29.57 
 
 		 940 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  30.9 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2768  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  31.75 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0848238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2986  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23000  branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  28.95 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.135077  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3859  ABC transporter related protein  28.86 
 
 		 924 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5602  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3841  inner-membrane translocator  28.77 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00122547  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5695  inner-membrane translocator  30 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  28.82 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3222  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 684 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7078  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  24.9 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  25.87 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5975  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  28.97 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4242  inner-membrane translocator  24.31 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7157  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  28.52 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  24.4 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0402  inner-membrane translocator  30.42 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  29.62 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4017  inner-membrane translocator  28.27 
 
 		 697 aa  72.8  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  24.26 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43530  amino acid ABC transporter-like protein  30.16 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0533478  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  23.84 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0734  inner-membrane translocator  28.39 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.993171  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0466  inner-membrane translocator  25.89 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0964978  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0686  inner-membrane translocator  27.82 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2331  inner-membrane translocator  26.42 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43770  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150883  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2749  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  27.99 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0611972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  26.32 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3004  inner-membrane translocator  27.65 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.961727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  26.78 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  24.05 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1742  inner-membrane translocator  25.39 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0350501  normal  0.0888724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3165  inner-membrane translocator  26.42 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3867  inner-membrane translocator  29.08 
 
 		 704 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.318133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3489  inner-membrane translocator  30.71 
 
 		 743 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3164  inner-membrane translocator  29.08 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109839  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0505  inner-membrane translocator  24.22 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0978839  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  24.56 
 
 		 294 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  26.16 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2270  inner-membrane translocator  27.92 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2952  inner-membrane translocator  25.57 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0349553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0216  inner-membrane translocator  29.96 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  30.68 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2545  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.59 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.322886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4711  inner-membrane translocator  26.47 
 
 		 292 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2937  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.65 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1606  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  25.65 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5342  inner-membrane translocator  25.17 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0863974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3989  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  25.65 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0197  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.65 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  25.65 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5664  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 741 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269421  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3374  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  25.65 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2519  inner-membrane translocator  25.94 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.964633  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  26.95 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2996  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  25.65 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3557  inner-membrane translocator  25.78 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  23.57 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  22.76 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4063  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  25.65 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1651  inner-membrane translocator  25.35 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  26.92 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3758  putative ABC transporter, permease protein  25.19 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1675  inner-membrane translocator  25.19 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4297  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.16 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315349  decreased coverage  0.00178163 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4940  inner-membrane translocator  28.22 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4038  inner-membrane translocator  27.57 
 
 		 816 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3492  inner-membrane translocator  29.18 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  24.57 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>