More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3332 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3332  type II secretion system protein E  100 
 
 		 449 aa  884    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0077596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1360  type II secretion system protein E  58.1 
 
 		 455 aa  434  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4644  type II secretion system protein E  32.97 
 
 		 452 aa  157  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  33.43 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  33.52 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  31.71 
 
 		 473 aa  151  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6894  type II secretion system protein E  34.84 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.261067 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  32.6 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  31.42 
 
 		 479 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  33.15 
 
 		 441 aa  147  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  34.41 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  34.51 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  34.88 
 
 		 447 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  34.88 
 
 		 446 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  34.88 
 
 		 447 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  34.88 
 
 		 447 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  32.51 
 
 		 467 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  34.4 
 
 		 447 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  33.88 
 
 		 450 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  32.96 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  33.82 
 
 		 454 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  33.82 
 
 		 447 aa  143  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  33.53 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  31.35 
 
 		 624 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  33.52 
 
 		 491 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  31.91 
 
 		 442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  33.24 
 
 		 491 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  33.82 
 
 		 450 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  32.77 
 
 		 500 aa  140  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  33.82 
 
 		 450 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  33.82 
 
 		 450 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  32.03 
 
 		 472 aa  140  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  32.79 
 
 		 452 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  30.5 
 
 		 460 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  36.31 
 
 		 474 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  35.24 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  33.02 
 
 		 449 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1541  type II secretion system protein E  34.9 
 
 		 437 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  34.75 
 
 		 472 aa  137  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  31.83 
 
 		 469 aa  137  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  32.79 
 
 		 445 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  31.51 
 
 		 462 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  34.08 
 
 		 476 aa  136  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  31.91 
 
 		 457 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8599  type II secretion system protein E  35.05 
 
 		 431 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126695  normal  0.494371 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  30.81 
 
 		 454 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  31.78 
 
 		 608 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8203  type II secretion system protein E  34.45 
 
 		 442 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  30.05 
 
 		 487 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  30.46 
 
 		 468 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  34.04 
 
 		 589 aa  133  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  31.95 
 
 		 464 aa  133  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1223  type II secretion system protein E  35.61 
 
 		 452 aa  133  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198137 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  32.27 
 
 		 449 aa  133  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  29.66 
 
 		 455 aa  133  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  30.32 
 
 		 453 aa  132  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1306  secretion ATPase protein  35.06 
 
 		 433 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.074017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  31.87 
 
 		 451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  31.19 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  30.59 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  31.87 
 
 		 451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  32.75 
 
 		 450 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  31.55 
 
 		 442 aa  132  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  29.54 
 
 		 451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  35.09 
 
 		 491 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  31.23 
 
 		 483 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  32.3 
 
 		 488 aa  131  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  30.95 
 
 		 482 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  32.77 
 
 		 492 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  32.94 
 
 		 438 aa  131  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4142  type II secretion system protein E  32.6 
 
 		 433 aa  131  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.965239  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  31.97 
 
 		 454 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  30.13 
 
 		 459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2567  type II secretion system protein E  32.33 
 
 		 469 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  32.46 
 
 		 477 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  30.97 
 
 		 467 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  35.29 
 
 		 638 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  33.96 
 
 		 408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  33.23 
 
 		 572 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  34.27 
 
 		 470 aa  130  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4031  type II secretion system protein E  31.37 
 
 		 442 aa  130  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148527  hitchhiker  0.00766622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  32.62 
 
 		 440 aa  129  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  30.5 
 
 		 458 aa  129  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  30.66 
 
 		 490 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1776  tight adherence protein TadA  35.79 
 
 		 335 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0119  secretion system protein, putaive  35.79 
 
 		 335 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0220928  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  31.79 
 
 		 569 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  31.09 
 
 		 513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  34.16 
 
 		 438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  30.66 
 
 		 484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  35.29 
 
 		 634 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  31.52 
 
 		 485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  33.76 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0628  type II secretion system protein E  30.84 
 
 		 521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  32.92 
 
 		 432 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  32.36 
 
 		 416 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  34.97 
 
 		 440 aa  127  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2274  putative secretory protein  33.95 
 
 		 446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414077  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  33.77 
 
 		 560 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  33.6 
 
 		 515 aa  127  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>