More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3861 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3861  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  100 
 
 		 499 aa  1022    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.94141 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0006  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.33 
 
 		 557 aa  124  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1602  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.52 
 
 		 418 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.46 
 
 		 319 aa  115  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0241  diguanylate cyclase  34.78 
 
 		 450 aa  113  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3085  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3185  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.46 
 
 		 482 aa  107  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3444  diguanylate cyclase  37.33 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1811  diguanylate cyclase  36.87 
 
 		 1037 aa  106  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688838  normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0689  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.85 
 
 		 356 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0928  diguanylate cyclase  37.33 
 
 		 323 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0918  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.33 
 
 		 323 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0109  diguanylate cyclase  36.14 
 
 		 461 aa  104  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1526  diguanylate cyclase  36.08 
 
 		 622 aa  104  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.480144  normal  0.0382354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0894  diguanylate cyclase  32.98 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.499341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5159  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.45 
 
 		 750 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0655785  normal  0.0151156 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0517  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.41 
 
 		 1072 aa  103  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2147  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.86 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1184  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.43 
 
 		 738 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5454  RNase II stability modulator  31.06 
 
 		 689 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1924  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.495061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3108  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.16 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1598  diguanylate cyclase  32.93 
 
 		 492 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0273825  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1021  diguanylate cyclase  35.29 
 
 		 300 aa  100  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000548579  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4694  diguanylate cyclase  32.23 
 
 		 492 aa  100  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1901  diguanylate cyclase  32.74 
 
 		 492 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6178  diguanylate cyclase  32.74 
 
 		 492 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0864  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.18 
 
 		 323 aa  99.8  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2763  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.61 
 
 		 751 aa  99.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.256566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1172  diguanylate cyclase  34.5 
 
 		 361 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00821476  hitchhiker  0.00260233 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0440  hypothetical protein  35.33 
 
 		 356 aa  99.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.06 
 
 		 1466 aa  99.4  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1152  RNase II stability modulator  31.06 
 
 		 667 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.584939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1527  diguanylate cyclase  34.39 
 
 		 642 aa  99.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.086696  normal  0.0345548 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0416  hypothetical protein  35.33 
 
 		 356 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2544  diguanylate cyclase  34.68 
 
 		 398 aa  98.6  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.871243  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0583  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.84 
 
 		 743 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0426  putative GGDEF protein  31.25 
 
 		 413 aa  99  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26970  hypothetical protein  26.37 
 
 		 525 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4503  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 492 aa  97.8  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1509  diguanylate cyclase  32.21 
 
 		 835 aa  97.8  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0192657  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0530  diguanylate cyclase  36.47 
 
 		 558 aa  97.8  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000155935  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1286  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.22 
 
 		 706 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.780244 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4045  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 492 aa  97.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5086  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.59 
 
 		 465 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2308  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.09 
 
 		 752 aa  97.1  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1141  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.68 
 
 		 432 aa  97.1  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00630975  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1996  GGDEF domain-containing protein  31.02 
 
 		 855 aa  97.1  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.473093  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3862  diguanylate cyclase  33.13 
 
 		 318 aa  96.7  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.561764  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2131  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.86 
 
 		 501 aa  96.7  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0749386  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1025  diguanylate cyclase  33.54 
 
 		 492 aa  96.7  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1021  diguanylate cyclase  33.54 
 
 		 492 aa  96.7  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0128107  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0395  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.24 
 
 		 745 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3759  GGDEF domain-containing protein  35.26 
 
 		 324 aa  96.3  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  31.86 
 
 		 321 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1898  diguanylate cyclase  34.43 
 
 		 300 aa  96.3  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.693267 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1834  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.51 
 
 		 571 aa  96.3  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000228382  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0645  diguanylate cyclase  29.52 
 
 		 659 aa  96.3  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2151  diguanylate cyclase  32.56 
 
 		 275 aa  96.3  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0517711 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4680  diguanylate cyclase  32.34 
 
 		 405 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2284  hypothetical protein  26.01 
 
 		 525 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0619167  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3319  sensory box protein  27.27 
 
 		 733 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0669106 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4554  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.86 
 
 		 331 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1139  GGDEF/GAF/EAL domain-containing protein  34.03 
 
 		 781 aa  95.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0850133  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0096  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.47 
 
 		 407 aa  95.5  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.758352  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0851  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.02 
 
 		 605 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2826  hypothetical protein  34.25 
 
 		 314 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0088  PAS:GGDEF  34.43 
 
 		 335 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0487  diguanylate cyclase  34.68 
 
 		 363 aa  95.9  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.468611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1844  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.99 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2361  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.71 
 
 		 661 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000283064  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00408  sensory transduction protein kinase  35.11 
 
 		 264 aa  94.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1517  RNase II stability modulator  33.71 
 
 		 661 aa  95.1  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.677881  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7376  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.97 
 
 		 736 aa  94.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1152  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.78 
 
 		 710 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0872705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1489  RNase II stability modulator  33.71 
 
 		 661 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0536587  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2296  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.8 
 
 		 749 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00930711  normal  0.870348 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1404  diguanylate cyclase  30.39 
 
 		 390 aa  94.4  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1480  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.49 
 
 		 1012 aa  94.4  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2185  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.83 
 
 		 777 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2206  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.67 
 
 		 752 aa  94.4  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1842  RNase II stability modulator  33.71 
 
 		 661 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0112439  hitchhiker  0.00000000000000244061 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1656  sensory box/response regulator  32.58 
 
 		 420 aa  94.4  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3590  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.04 
 
 		 443 aa  94.4  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.54 
 
 		 1125 aa  94  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3337  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.71 
 
 		 1020 aa  94  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0429  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  35.23 
 
 		 874 aa  94.4  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2284  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.69 
 
 		 749 aa  94  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4570  hypothetical protein  30.69 
 
 		 749 aa  94  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0379  diguanylate cyclase  35.4 
 
 		 540 aa  94  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1609  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.7 
 
 		 796 aa  94  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248445 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3576  diguanylate cyclase  34.57 
 
 		 484 aa  94  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0764  GGDEF domain-containing protein  26.7 
 
 		 905 aa  93.6  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2181  RNase II stability modulator  28.41 
 
 		 663 aa  93.6  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276855 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01262  modulator of Rnase II stability  33.15 
 
 		 661 aa  93.2  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.56782  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1398  RNase II stability modulator  33.15 
 
 		 661 aa  93.2  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000044388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2042  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.23 
 
 		 749 aa  93.2  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2088  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.52 
 
 		 577 aa  93.2  9e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0214  diguanylate cyclase  34.18 
 
 		 362 aa  93.2  9e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.33 
 
 		 415 aa  93.2  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>