79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0336 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 225 aa  424  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0217  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.13 
 
 		 222 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0016043  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  49.77 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0323  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.65 
 
 		 273 aa  180  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.147172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2082  lysine exporter protein (LysE/YggA)  43.03 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  39.62 
 
 		 217 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.83 
 
 		 214 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0663  lysine exporter protein LysE/YggA  41.31 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.92475  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  39.22 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0570  lysine exporter protein LysE/YggA  38.76 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0391767  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.54 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  35.65 
 
 		 218 aa  112  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0655  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.01 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  33.18 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  29.77 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  31.92 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  32.39 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0711  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206617  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  31.78 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1858  lysine exporter protein LysE/YggA  29.74 
 
 		 204 aa  67  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2018  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0646  lysine exporter protein LysE/YggA  25 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0708  lysine exporter protein LysE/YggA  29.89 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000114889 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3051  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.19 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1264  lysine exporter protein LysE/YggA  28.33 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1225  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.11 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3401  lysine exporter protein LysE/YggA  30.56 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.211755  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3067  lysine exporter protein LysE/YggA  29.57 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000755929  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  30.1 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  28.57 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  28.57 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  28.57 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  28.57 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  28.57 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0221  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.98 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1401  lysine exporter protein LysE/YggA  38.16 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582865  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1483  lysine exporter protein LysE/YggA  26.87 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.84 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  28.06 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0232  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.83 
 
 		 202 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3023  LysE family translocator protein  28.06 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.917824  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1525  LysE family protein  27.78 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0571037  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  29.57 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  25.88 
 
 		 213 aa  45.1  0.0009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.84 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  29.65 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.95 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  30.41 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.55802  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2446  lysine exporter protein LysE/YggA  29.41 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  23.15 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0810  lysine exporter protein LysE/YggA  28.14 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  29.22 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.79 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5239  lysine exporter protein LysE/YggA  26.97 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0441  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.05 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.57 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.88 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3657  amino acid transporter LysE  29.78 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0821  lysine exporter protein LysE/YggA  29.5 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  28.49 
 
 		 204 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2697  lysine exporter protein LysE/YggA  25.66 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  33.08 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0472  lysine exporter protein LysE/YggA  27.78 
 
 		 237 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0951  lysine exporter protein LysE/YggA  27.78 
 
 		 237 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3328  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.82 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740014  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1221  transporter, LysE family  28.83 
 
 		 209 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1064  lysine exporter protein LysE/YggA  29.82 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150207  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1031  lysine exporter protein LysE/YggA  29.82 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0778058  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2176  lysine exporter protein LysE/YggA  24.75 
 
 		 189 aa  42.4  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000305264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.67 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1986  lysine exporter protein LysE/YggA  29.01 
 
 		 209 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6091  lysine exporter protein LysE/YggA  29.01 
 
 		 209 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0972486  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0208  lysine exporter protein LysE/YggA  28.04 
 
 		 202 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3407  lysine exporter protein LysE/YggA  26.97 
 
 		 210 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2660  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.08 
 
 		 191 aa  42  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000253226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1430  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.5 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  34.26 
 
 		 207 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0229835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>