28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0711 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0711  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 191 aa  370  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206617  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2516  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.19 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0680  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00731166  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0663  lysine exporter protein LysE/YggA  28.11 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.92475  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0655  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.44 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0336  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 225 aa  72  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0310124  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  27.67 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1638  lysine exporter protein LysE/YggA  28.06 
 
 		 227 aa  71.2  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  27.64 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000434422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0820  lysine exporter protein LysE/YggA  31.73 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000331206  hitchhiker  0.00549448 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0570  lysine exporter protein LysE/YggA  30.5 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0391767  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1436  lysine exporter protein LysE/YggA  28.22 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2082  lysine exporter protein (LysE/YggA)  38.54 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1858  lysine exporter protein LysE/YggA  30.1 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2018  lysine exporter protein LysE/YggA  31.49 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0036  lysine exporter protein LysE/YggA  27.09 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  28.14 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13310  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.8 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00102117  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0323  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.42 
 
 		 273 aa  58.2  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.147172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0217  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.48 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0016043  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  28.04 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0646  lysine exporter protein LysE/YggA  26.42 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  25.73 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  27.14 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1264  lysine exporter protein LysE/YggA  30.12 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0708  lysine exporter protein LysE/YggA  29.03 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000114889 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3244  LysE type translocator  23.76 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.549146  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1138  lysine exporter protein LysE/YggA  26.9 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>