43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1138 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1138  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
217 aa  420  1e-117  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0391  lysine exporter protein LysE/YggA  45.13 
 
 
201 aa  136  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.24 
 
 
186 aa  134  9e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2176  lysine exporter protein LysE/YggA  38.74 
 
 
189 aa  131  7.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000305264 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1371  lysine exporter protein LysE/YggA  43.88 
 
 
206 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.57 
 
 
226 aa  89.4  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.91 
 
 
239 aa  84  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0239  amino acid transporter LysE  31.79 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0656  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.52 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.434782  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1153  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter, LysE family  29.9 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000661162  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.64 
 
 
226 aa  74.7  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0626  amino acid transporter LysE  31.94 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.38737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  27.7 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.29 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.300791  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  28.29 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1193  amino acid transporter LysE  32.28 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.728705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  27.86 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1070  amino acid transporter LysE  32.92 
 
 
199 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.272013  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0687  amino acid transporter LysE  31.68 
 
 
199 aa  62.4  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  24.02 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  24.53 
 
 
247 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  24.38 
 
 
247 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  24.26 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  24.02 
 
 
210 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  24.02 
 
 
210 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  24.02 
 
 
233 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  24.38 
 
 
210 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  23.53 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  26.09 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  23.53 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  25.93 
 
 
208 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  25.93 
 
 
208 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  26.02 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  25.4 
 
 
208 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0329  amino acid transporter LysE  27.13 
 
 
206 aa  52.4  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  25.4 
 
 
208 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  25.4 
 
 
208 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_271  transporter, LysE family  26.6 
 
 
207 aa  52  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  24.87 
 
 
208 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0309  lysine exporter protein LysE/YggA  27.66 
 
 
207 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1393  hypothetical protein  27.4 
 
 
218 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0711  lysine exporter protein LysE/YggA  27.6 
 
 
191 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206617  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0888  lysine exporter protein LysE/YggA  24.6 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.668433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>