101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0239 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0239  amino acid transporter LysE  100 
 
 
199 aa  375  1e-103  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0626  amino acid transporter LysE  45.27 
 
 
200 aa  162  3e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.38737  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0687  amino acid transporter LysE  42.35 
 
 
199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1153  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter, LysE family  42.35 
 
 
197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000661162  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1193  amino acid transporter LysE  41.84 
 
 
199 aa  139  3e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.728705  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1070  amino acid transporter LysE  42.35 
 
 
199 aa  137  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.272013  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2905  hypothetical protein  33 
 
 
208 aa  89  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2875  hypothetical protein  32.5 
 
 
208 aa  89  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000177691  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3124  hypothetical protein  33 
 
 
208 aa  89  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3126  hypothetical protein  32.5 
 
 
208 aa  89  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2832  amino acid transporter LysE  33 
 
 
208 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3148  hypothetical protein  32.5 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1716  lysine exporter protein LysE/YggA  31.03 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.57 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.300791  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0903  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.04 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.32 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1138  lysine exporter protein LysE/YggA  29.12 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2176  lysine exporter protein LysE/YggA  31.05 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000305264 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.36 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3066  hypothetical protein  28.57 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0359182  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2768  hypothetical protein  28.57 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0752223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2754  amino acid transporter LysE  28.57 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0279603  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2982  LysE family translocator protein  34.51 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2660  LysE family translocator  33.8 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.094148  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0391  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1423  lysine exporter protein LysE/YggA  26.32 
 
 
229 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1773  hypothetical protein  27.23 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.499811  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0343  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.58 
 
 
239 aa  63.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1722  hypothetical protein  26.73 
 
 
211 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1514  hypothetical protein  26.24 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1631  hypothetical protein  26.24 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1699  hypothetical protein  26.24 
 
 
233 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1476  amino acid transporter LysE  26.24 
 
 
210 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.654026  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3676  hypothetical protein  30.4 
 
 
247 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636244  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1519  lysine exporter protein LysE/YggA  26.24 
 
 
233 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1668  hypothetical protein  26.24 
 
 
247 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1383  amino acid exporter, putative  28.46 
 
 
212 aa  58.2  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0228718 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1486  amino acid transporter LysE  25.74 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00591453  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  30.47 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03425  hypothetical protein  28.49 
 
 
230 aa  57.8  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0656  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.81 
 
 
235 aa  56.6  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.434782  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  27.59 
 
 
203 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2412  lysine exporter protein LysE/YggA  24.48 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3570  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.13 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  28.1 
 
 
210 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  28.1 
 
 
210 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5851  lysine exporter protein LysE/YggA  28.1 
 
 
210 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4033  lysine exporter protein LysE/YggA  29.03 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.133975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  22.92 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1371  lysine exporter protein LysE/YggA  30.88 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  27.27 
 
 
223 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  31.36 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0178  lysine exporter protein LysE/YggA  26.37 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13999  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0858  lysine exporter protein LysE/YggA  31.54 
 
 
211 aa  48.9  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.74992  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  32.14 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  30.56 
 
 
219 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1198  lysine exporter protein LysE/YggA  28.46 
 
 
201 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.57 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4333  lysine exporter protein LysE/YggA  25.6 
 
 
220 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364996  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1555  putative LysE family amino-acid efflux protein  33.33 
 
 
201 aa  45.8  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  32.61 
 
 
218 aa  45.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3087  amino acid transporter LysE  27.64 
 
 
197 aa  45.4  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0525749  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1015  lysine exporter protein LysE/YggA  25.99 
 
 
225 aa  45.1  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.486476  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0570  lysine exporter protein LysE/YggA  26.18 
 
 
200 aa  44.7  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0391767  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  30.17 
 
 
209 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  31.3 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2276  amino acid transporter  30.51 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.23 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1656  lysine exporter protein LysE/YggA  21.26 
 
 
217 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268665  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  26.79 
 
 
194 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1998  amino acid efflux pump, RhtB family protein  28.57 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457454  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  27.07 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3064  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  29.51 
 
 
234 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.73 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  25.44 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  25.44 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3887  lysine exporter protein LysE/YggA  27.12 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  25.44 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  25.44 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  25.44 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  25.44 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  25.44 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4042  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.14 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1266  homogentisate export protein  29.38 
 
 
198 aa  42.7  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.733193  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0833  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.61 
 
 
221 aa  42.4  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0051  amino acid transporter LysE  29.84 
 
 
210 aa  42  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  26.79 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  26.79 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4348  lysine exporter protein LysE/YggA  25.42 
 
 
212 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  28.69 
 
 
210 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  26.79 
 
 
215 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.45 
 
 
209 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3823  hypothetical protein  23.44 
 
 
220 aa  41.6  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121747  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3720  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.25 
 
 
213 aa  41.6  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.71 
 
 
211 aa  41.6  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  31.25 
 
 
213 aa  41.6  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5050  lysine exporter protein LysE/YggA  27.03 
 
 
218 aa  41.6  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.637848 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.41 
 
 
210 aa  41.2  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>