More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4996 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
243 aa  484  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  88.13 
 
 
234 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  89.47 
 
 
210 aa  363  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  86.45 
 
 
215 aa  359  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  85.98 
 
 
215 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  85.98 
 
 
215 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  85.24 
 
 
210 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  84.29 
 
 
210 aa  350  8e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  89.12 
 
 
194 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  75.71 
 
 
210 aa  319  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  75.24 
 
 
210 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  75.71 
 
 
213 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6503  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  76.67 
 
 
210 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  75.36 
 
 
211 aa  311  6.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  74.29 
 
 
210 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  75.24 
 
 
210 aa  308  5e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  71.43 
 
 
211 aa  304  7e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  70.95 
 
 
210 aa  304  8.000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  68.06 
 
 
288 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  69.05 
 
 
210 aa  300  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  72.38 
 
 
212 aa  299  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3551  lysine exporter protein LysE/YggA  70.48 
 
 
210 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  68.12 
 
 
209 aa  281  5.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  67.62 
 
 
210 aa  278  8e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  66.67 
 
 
210 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  64.76 
 
 
210 aa  269  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  65.53 
 
 
232 aa  265  5.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0366  RhtB family transporter  66.19 
 
 
210 aa  264  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  61.9 
 
 
210 aa  256  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  62.89 
 
 
212 aa  241  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  59.8 
 
 
214 aa  236  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  56.04 
 
 
215 aa  231  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  54.41 
 
 
211 aa  220  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  56.63 
 
 
215 aa  220  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  55 
 
 
212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.93 
 
 
211 aa  211  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5788  lysine exporter protein LysE/YggA  53.2 
 
 
215 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.51444  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6153  lysine exporter protein LysE/YggA  53.2 
 
 
215 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757704  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6633  lysine exporter protein LysE/YggA  53.2 
 
 
215 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6036  lysine exporter protein LysE/YggA  53.69 
 
 
229 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7707  lysine exporter protein LysE/YggA  52.71 
 
 
215 aa  207  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5806  lysine exporter protein LysE/YggA  53.2 
 
 
215 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0739  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  56.22 
 
 
210 aa  201  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3214  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  56.02 
 
 
198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4218  L-lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.71 
 
 
212 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  39.52 
 
 
210 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  41.55 
 
 
210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  38.57 
 
 
210 aa  145  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  39.23 
 
 
210 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  39.23 
 
 
210 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  40.38 
 
 
210 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  41.06 
 
 
210 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.15 
 
 
210 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  38.36 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  39.13 
 
 
206 aa  129  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.34 
 
 
209 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  42.51 
 
 
203 aa  122  7e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.38 
 
 
216 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35 
 
 
212 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  35.92 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.31 
 
 
218 aa  118  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3911  putative amino acid (threonine) efflux protein  37.56 
 
 
208 aa  118  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856049  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  37.68 
 
 
215 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.32 
 
 
223 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.31 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  30.62 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.61 
 
 
208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.32 
 
 
209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.46 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  33.96 
 
 
213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.89 
 
 
207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.85 
 
 
208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  32.39 
 
 
211 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 
204 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  34.74 
 
 
206 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5446  lysine exporter protein LysE/YggA  38.25 
 
 
214 aa  111  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.52 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3130  lysine exporter protein LysE/YggA  35.96 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.376796 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  36.87 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  33.82 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.92 
 
 
211 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  33.82 
 
 
204 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  33.82 
 
 
204 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.49 
 
 
208 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  31.92 
 
 
211 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  31.92 
 
 
211 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  31.92 
 
 
211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  31.92 
 
 
211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  34.67 
 
 
214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  31.92 
 
 
211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  31.92 
 
 
211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  33.82 
 
 
204 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1998  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.57 
 
 
213 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457454  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 
213 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  32.37 
 
 
204 aa  108  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  35.16 
 
 
211 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  31.4 
 
 
204 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  29.27 
 
 
208 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  32.37 
 
 
204 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  32.37 
 
 
227 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>